Python生物信息学数据管理——第1、2章课后习题

这篇博客主要介绍了Python在生物信息学数据管理的应用,包括计算化学反应的ΔG值、单位转换、pH值计算、细菌细胞体积估算以及生物序列的分析,如氨基酸和核苷酸频率统计、序列操作等。
摘要由CSDN通过智能技术生成

#初学小白,仅供参考
1.1计算所有三种组织中的ΔG值

import math
def detlaG(ATP,ADP,Pi):
    R=0.00831
    T=298
    deltaG0=-30.5
    return deltaG0+R*T*math.log(ADP*Pi/ATP)
print('肝中:',detlaG(3.5,1.8,5.0))
print('肌肉中:',detlaG(8.0,0.9,8.0))
print('脑中:',detlaG(2.6,0.7,2.7))

1.2将值转化为千卡

print('肝中:',detlaG(3.5,1.8,5.0)/4.184,'kJ/mol')
print('肌肉中:',detlaG(8.0,0.9,8.0)/4.184,'kJ/mol')
print('脑中:',detlaG(2.6,0.7,2.7)/4.184,'kJ/mol')

1.3计算pH值

import math
cH=0.00316*0.001
pH=-math.log10(cH)
print(pH)

1.4指数生长

total=1
for i in range(20,361,20):
    total*=2
print(total)

1.5计算单个细菌细胞体积

import math
l=2.0
d=0.5
v=math.pi*(d/2)**2*l
print('单个大肠杆菌细胞体积是{:.2}um³'.format(v))

2.1端粒蛋

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