[问题已处理]-docker build报错make :bin:sh Operation not permitted

最新推荐文章于 2024-05-31 14:29:50 发布
最新推荐文章于 2024-05-31 14:29:50 发布
阅读量1.3k 收藏
点赞数 1
分类专栏： 问题已处理 文章标签： docker 容器 运维
仅供学习参考 转载请标明出处。个人笔记为自己记录 如果对大家有帮助那也挺好 写的马虎 如果有不对的地方谢谢指正 各位大佬别喷哦
本文链接：https://blog.csdn.net/xujiamin0022016/article/details/131682090
版权
该Dockerfile描述了在Ubuntu22.04基础上安装CUDA,pycuda,TensorRT等组件的步骤，包括下载、解压、配置和编译。在构建过程中遇到Operationnotpermitted错误，可能与权限或临时文件系统挂载有关。
摘要由CSDN通过智能技术生成

导语：在构建docker image的过程中报错make /bin/sh Operation not permitted

RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH \
&&  cd /tmp && wget -c http://172.16.40.245:82/pycuda-2021.1.tar.gz \
&&  tar zxvf pycuda-2021.1.tar.gz \
&&  cd /tmp/pycuda-2021.1 && ./configure.py --cuda-root=/usr/local/cuda --cxxflags=-std=c++11  \
&&  make install \
&&  find /usr/local/lib -name '*.pyc' -delete \
&&  apt autoremove -y  \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&&  rm -rf /root/.cache/pip/ \
&&  ldconfig

docker build -t  test01:pycuda .


RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH \
&&  cd /tmp && wget -c http://172.16.40.245:82/pycuda-2021.1.tar.gz \
&&  tar zxvf pycuda-2021.1.tar.gz \
&&  apt update && apt-get install python3-dev -y  \
&&  cd /tmp/pycuda-2021.1 && ./configure.py --cuda-root=/usr/local/cuda --cxxflags=-std=c++11  \
&&  /usr/bin/python3 setup.py install \
&&  find /usr/local/lib -name '*.pyc' -delete \
&&  apt autoremove -y  \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&&  rm -rf /root/.cache/pip/ \
&&  ldconfig

完整Dockerfile如下

### builder 先在builder中解压
#FROM ubuntu:22.04 as builder-TensorRT
#COPY TensorRT-8.0.1.6.tgz /opt/
#RUN tar zxf /opt/TensorRT-8.0.1.6.tgz -C /opt/ \
#&& rm -rf TensorRT-8.0.1.6.tgz

#FROM ubuntu:22.04 as builder-jsoncpp_dcmtk_opencv_node
#COPY jsoncpp_dcmtk_opencv_node.tgz  /opt/
#RUN tar zxf /opt/jsoncpp_dcmtk_opencv_node.tgz  -C /opt/ \
#&& rm -rf jsoncpp_dcmtk_opencv_node.tgz



#FROM ubuntu:22.04 as builder-freesurfer
#COPY freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.0.tgz  /opt/
#RUN tar zxf /opt/freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.0.tgz  -C /usr/local/ \
#&& rm -rf /opt/freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.0.tgz


### 正式构建
#FROM nvidia/cuda:11.7.0-devel-ubuntu22.04
#FROM nvidia/cuda:11.7.0-runtime-ubuntu22.04
FROM nvidia/cuda:11.7.0-base-ubuntu22.04
# 作者
MAINTAINER xujiamin

#COPY --from=builder-TensorRT   /opt/TensorRT-8.0.1.6 /opt/TensorRT-8.0.1.6
COPY sources.list.ali  /srv/sources.list.ali
# 先安装python3.10
RUN sed -i -e 's/^APT/# APT/' -e 's/^DPkg/# DPkg/' /etc/apt/apt.conf.d/docker-clean \
&&  rm -rf /etc/apt/sources.list.d/* \
&&  apt-get update \
&&  apt-get install python3.10 -y --no-install-recommends \
# 安装egl
&&  apt-get install libegl1-mesa-dev libgles2-mesa-dev -y --no-install-recommends \
&&  rm -rf /usr/bin/python3 \
&&  ln -s /usr/bin/python3.10 /usr/bin/python3 \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&&  rm -rf /root/.cache/pip/

# 安装基础命令及排查命令
RUN apt update \
&&  apt-get install vim lsof git zip rsync pigz curl telnet wget unzip net-tools inetutils-ping -y --no-install-recommends \
&&  apt-get install make gcc g++  -y --no-install-recommends \
# 设置时区
&&  DEBIAN_FRONTEND="noninteractive" apt-get install tzdata -y --no-install-recommends \
&&  rm -rf /etc/localtime \
&&  ln -s /usr/share/zoneinfo/Asia/Shanghai /etc/localtime \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/*

# 解压编译好的openfoa7
RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  cd /tmp \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/2204/openfoam7_2204.tgz \
&&  tar zxvf openfoam7_2204.tgz  &&  mv srv/OpenFOAM-7  /opt/openfoam7 && rm -rf /tmp/openfoam7_2204.tgz \
&&  ldconfig

# 解压安装cudnn
RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  cd /tmp \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/2204/cudnn-11.2-linux-x64-v8.1.1.33.tgz \
&&  tar  -xpPf /tmp/cudnn-11.2-linux-x64-v8.1.1.33.tgz -C /usr/local/ && rm -rf /tmp/cudnn-11.2-linux-x64-v8.1.1.33.tgz \
&&  ldconfig

# 解压VTK
RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  cd /tmp \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/VTK-8.2.0.tgz \
&&  tar zxvf VTK-8.2.0.tgz && rm -rf /usr/local/include/vtk-8.2 && cp -rf VTK-8.2.0/* /usr/local/  \
&&  rm -rf /srv/VTK-8.2.0 && rm -rf /tmp/VTK-8.2.0.tgz \
&&  ldconfig

# 安装python依赖
RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  cd /tmp \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/2204/pythonlib_drwise_2.0.tgz \
&&  rm -rf /usr/lib/python* /usr/local/lib/python* \
&&  tar  xpPf pythonlib_drwise_2.0.tgz -C / \
&&  find /usr/local/lib -name '*.pyc'  -delete \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&&  rm -rf /root/.cache/pip/

COPY get-pip.py /srv/get-pip.py
# 安装pip
RUN python3 /srv/get-pip.py  -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple \
&&  python3  -m pip install --upgrade pip -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&&  rm -rf /root/.cache/pip/

# 设置env
RUN echo "export LC_ALL='C.UTF-8'" >> /root/.bashrc \
&&  echo "export LANG='C.UTF-8'" >> /root/.bashrc \
&&  echo "export ANTSPATH=/usr/local/ANTs.2.1.0.Debian-Ubuntu_X64" >> /root/.bashrc \
&&  echo "export DCMDICTPATH=/usr/local/share/dcmtk/dicom.dic" >>/root/.bashrc \
&&  echo "export DCMDICTPATH=/usr/local/share/dcmtk/dicom.dic" >>/etc/profile  \
&&  echo "export CUDA_ROOT=/usr/local/cuda" >> /root/.bashrc \
&&  echo "export PATH=\$PATH:\$ANTSPATH" >> /root/.bashrc \
&&  echo "export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib/:\$LD_LIBRARY_PATH" >> /root/.bashrc \
#&&  echo "export LD_LIBRARY_PATH=/opt/TensorRT-8.0.1.6/lib:/usr/local/lib/:\$LD_LIBRARY_PATH" >> /root/.bashrc \
&&  echo "export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib/:\$LD_LIBRARY_PATH" >> /root/profile
#&&  echo "export LD_LIBRARY_PATH=/opt/TensorRT-8.0.1.6/lib:/usr/local/lib/:\$LD_LIBRARY_PATH" >> /root/profile


ENV LC_ALL C.UTF-8
ENV LANG C.UTF-8
ENV ANTSPATH /usr/local/ANTs.2.1.0.Debian-Ubuntu_X64
ENV DCMDICTPATH /usr/local/share/dcmtk/dicom.dic
ENV PATH $PATH:$ANTSPATH
ENV LD_LIBRARY_PATH /usr/local/lib/:$LD_LIBRARY_PATH
#ENV LD_LIBRARY_PATH /opt/TensorRT-8.0.1.6/lib:/usr/local/lib/:$LD_LIBRARY_PATH


# 这里最好根据最新的显卡版本进行更新   否则会出现cuda 804
COPY libcuda.so.525.89.02 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcuda.so.525.89.02
COPY libcudadebugger.so.525.89.02  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcudadebugger.so.525.89.02
RUN rm -rf /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcuda.so.1 \
&&  ln -s  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcuda.so.525.89.02 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcuda.so.1 \
&&  ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcudadebugger.so.525.89.02 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcudadebugger.so.1 \
&&  ln -s  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcuda.so.1  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcuda.so \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&&  rm -rf /root/.cache/pip/ \
&&  ldconfig


COPY ANTs.2.1.0.Debian-Ubuntu_X64  /usr/local/ANTs.2.1.0.Debian-Ubuntu_X64
# 修改sh 到bash
RUN rm /bin/sh && ln -s /bin/bash /bin/sh


# 因gcc问题重新编译ACVD
RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  cd /tmp \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/of_package.tgz \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/of_install.sh  \
&&  chmod +x of_install.sh \
&&  bash of_install.sh \
&&  ln -sf /root/lung/CTFFR/ACVD/bin/ACVD /usr/bin/

# 安装peisu需要的算法依赖
RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  cd /tmp \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/2204/peisu/lung_lib.tgz \
&&  tar zxvf lung_lib.tgz \
&&  cp /tmp/lib/*  /lib/x86_64-linux-gnu/

RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  cd /tmp/ \
&&  wget -c http://172.16.40.245:82/2204/cuda/cuda_debs_2204.tgz \
&&  tar zxvf cuda_debs_2204.tgz \
&&  cp /tmp/lib/*  /usr/local/cuda/lib64/ \
&&  cp -r /tmp/include /usr/local/cuda/targets/x86_64-linux/ \
                      #/usr/local/cuda-11.3/targets/x86_64-linux/include/cuda.h
&&  cp -r /tmp/stubs /usr/local/cuda/targets/x86_64-linux/lib/ \
&&  rm -rf /tmp/* \
&&  ldconfig

RUN  --mount=type=tmpfs,target=/tmp  export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH \
&&  cd /tmp && wget -c http://172.16.40.245:82/pycuda-2021.1.tar.gz \
&&  tar zxvf pycuda-2021.1.tar.gz \
&&  apt update && apt-get install python3-dev -y \
&&  cd /tmp/pycuda-2021.1 && ./configure.py --cuda-root=/usr/local/cuda --cxxflags=-std=c++11  \
&&  cd /tmp/pycuda-2021.1  \
&&  export CUDA_ROOT=/usr/local/cuda \
&&  export NVCC=$CUDA_ROOT/bin/nvcc \
&&  export CUDA_INCLUDE=$CUDA_ROOT/include \
&&  export CFLAGS="-I/usr/local/cuda-11.7/targets/x86_64-linux/include" \
&&  /usr/bin/python3 setup.py install \
&&  find /usr/local/lib -name '*.pyc' -delete \
&&  apt autoremove -y  \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&&  rm -rf /root/.cache/pip/ \
&&  ldconfig

# libglib2.0-dev 请务必最后安装 会造成dpkg异常
RUN apt update \
&&  DEBIAN_FRONTEND="noninteractive" apt-get install libcurand10  -y --no-install-recommends \
&&  apt-get install libxrender1  -y --no-install-recommends \
&&  apt-get install libglib2.0-dev  -y --no-install-recommends \
# 清理hook提示
#&&  echo > /etc/dpkg/dpkg.cfg.d/pkg-config-hook-config \
&&  apt clean \
&&  rm -rf /var/lib/apt/lists/*

最终通过查看install的最终命令如执行python3 setup.py install解决。

爷来辣
关注
  • 1
    点赞
  • 踩
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 0
    评论
专栏目录
tg-time-tdlib-build-docker:在Docker上构建tdlib
04-09
构建docker build --tag=jeudesprits/tg-time-tdlib-build-docker .容器： docker build --tag=jeudesprits/tg-time-tdlib-build-docker . 运行Docker容器。 确保您指定了正确的路径来复制libtdjson.so文件。 例子...
docker build 镜像时报错 make: /bin/sh: Operation not permitted
weixin_43841942的博客
03-30 2040
因为某个原因，无法pull位于gcr的镜像，所以只能源码编译，在执行的时候报了一串的, 往上翻了一圈，发现都是些chmod +x、 关闭selinux，和我的情况完全不同。只能去翻外站看英文 emmm….. .
docker 中遇到fork/exec /bin/sh: operation not permitted错误
qq_41763749的博客
05-21 3906
在Docker中运行fork的go程序时 /* UTS Namespace主要用来隔离nodename和domainname两个系统标识。在UTS namespace里，每个namespace允许有自己的hostname。 系统API 中的clone()创建新的进程。根据填入的参数来判断哪些namesapce会被创建，而且它们的子进程也会被包含到这些namespace中。 */ package main import ( "os/exec" "syscall" "os" "log" ) fun
docker运行centos提示Operation not permitted
最新发布
七夜的博客
05-31 1268
在运行centos镜像的时候加上--privileged参数。
Docker 解决Operation not permitted问题
contiguous的博客
11-02 6684
解决Docker中安装PHP扩展包没有权限的问题
docker容器内, make 报错 Operation not permitted
weixin_45169032的博客
04-18 4568
alpine、Operation not permitted、$(shell pwd)
php:*-alpine のdocker build make: /bin/sh: Operation not permitted make: *** [Makefile:209: redis.lo]...
Tinywan
10-24 1442
[解決済み] php:*-alpine のdocker buildで、`make: /bin/sh: Operation not permitted` エラーが発生する PHPDockeralpine はじめに(何が問題か) 以下のようなDockerfileをビルドすると、 FROM php:7.4-cli-alpine RUN set -ex \ && apk ...
alpine镜像make报Operation not permitted
alim2012的博客
07-13 4850
alpine镜像make报Operation not permitted，如下： 但在命令行可以直接执行 /bin/sh 原因： alpine 3.14的版本问题，3.13及以下版本没有问题
/bin/sh: bad interpreter: Operation not permitted
weixin_45463877的博客
04-21 3070
在mac系统在执行./android-sdk-macosx/tools/android这句时候遇到了错误： -bash: ./android-sdk-macosx/tools/android: /bin/sh: bad interpreter: Operation not permitted 折腾了一段时间后，发现是/android-sdk-macosx/tools/android这个文件的问题...
docker-build-push:Docker Build＆Push GitHub操作
05-08
Docker构建和推送操作 构建一个Docker映像并将其推送到您选择的私有注册表中。 支持的Docker注册表 Docker集线器 Google Container Registry（GCR） ... - uses : mr-smithers-excellent/docker-buil
macaca-android-docker::spouting_whale:MacacaAndroid Docker映像
05-10
$ docker build ./build -t= " macacajs/macaca-android-build-docker " 用法 $ docker run -it --entrypoint= " /bin/bash " macacajs/macaca-android-docker $ android update sdk --proxy-host mirrors.neusoft....
aws-codebuild-images:带有锈蚀的AWS CodeBuild Docker映像
03-30
slim：使用AWS CLI v2和Docker-in-Docker的Debian稳定slim 细锈：像细锈一样，但已安装了锈 slim-rust-cache：与slim-rust类似，但安装了 您可以使用下载图像 docker pull couragium/aws-codebuild-images:tag...
解决docker desktop报错InvalidTransitionException:
01-04
解决Docker.ApiServices.StateMachines.... 在 Docker.ApiServices.StateMachines.UnstableState.Docker.ApiServices.StateMachines.IInternalEngineState.BeginStopAsync() 位置 C:\workspaces\PR-17132\src\github....
unable to execute xxx.sh : Operation not permitted 问题
明明如月的技术博客
12-02 3313
一、背景 之前在本地创建了 shell 脚本，在 iterm 中可以通过 ./xxxx.sh 的方式去执行。 今天突然发现报了如下错误： unable to execute xxx.sh : Operation not permitted 或者 -bash: ./xxx.sh: /usr/bin/env: bad interpreter: Operation not permitted 最近把系统升级为 Monterey 版本，怀疑和系统升级有关系。 二、解决办法 ls -l 查看权限 发现有执
docker
morning_china的专栏
09-29 379
创建一个linux环境:基于Ubuntu，然后安装一些软件 1）docker run -i -t ubuntu /bin/bash --------创建并登录一个 ubuntu 环境 2）apt-get update --------------更新 apt-get 软件 3）root@6aad6c39f6af:/# g++ bash: g++: command not found --------没有c++编译器 4）root@6aad6c39f6af:/# vim helloworld.c.
Mac OS操作/usr/bin目录时报“Operation not permitted”的问题
培根芝士的专栏
04-09 6503
Rootless机制是OSX10.11之后发布的一个内核保护措施，用来对抗恶意程序的破坏。系统默认会锁定/system、/sbin、/usr三个目录，即便设置 root 权限同样不可以。 重启按住 Command+R，进入恢复模式，在菜单栏中打开Terminal。 查看Rootless是否开启 csrutil status 关闭 Rootless csrutil disable 开...
MacOS初识SIP——解决快捷指令sh脚本报错Operation not permitted
灰蜗牛
04-09 1306
通过快捷指令运行脚本，奇怪的是在快捷指令窗口下运行一切正常，但是从Command+Space 打开下执行就换出现报错。记录下整个排查过程。​文章目的：分享排查思路和过程、介绍SIP（又水一篇文章~ 😆 ）
MAC /usr/bin/目录下 Operation not permitted的解决
热门推荐
丿灬安之若死
06-11 2万+
mac系统下的Rootless机制，让我们在root权限下也不能随心所欲的读写所有路径了，特殊情况下我们需要关闭Rootless时，可尝试如下操作： 1. 重启按住 Command+R，进入恢复模式，打开Terminal。 2. 键入命令 csrutil disable 3. reboot Rootless机制是对抗恶意程序的最后防线，除非特殊需要时我们才将其关闭，否则保持开启状态csrutil ...
【云原生】解决在Windows上在docker内启动docker报Operation not permitted
zxln007的博客
03-10 3476
然后我们进入到该容器内，用 docker-compose 命令启动所有其他容器。现在我们用一个命令先启动 all-in-one 容器，该容器挂载了。docker-compose.yml 部分配置如下。容器，在容器内将项目所有其他容器启动。postgresql 也有类似的报错。位于all-in-one容器内。例如启动redis 的报错。这样挂载后，就都可以起来了。
docker容器内使用yum install -y yum报错bash: yum: command not found
12-15
在Docker容器内使用yum命令时，可能会出现“bash: yum: command not found”错误。这是因为Docker容器内默认没有安装yum包管理器。您可以通过以下步骤安装yum包管理器： 1.更新apt-get包管理器： ```shell apt-get update ``` 2.安装yum包管理器： ```shell apt-get install yum ``` 安装完成后，您就可以在Docker容器内使用yum命令了。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

爷来辣

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值