24年总结
2024-09-21到2024-09-25 参加了研究生数学建模比赛,花了四天半时间,最后拿了国三。
2024-11-01 复现了第一个深度学习项目,一个视觉方向的开源项目,主要是通过这个了解整个项目的运行。第一个深度学习项目的笔记
然后就是按部就班学习一些基础算法,自己找过两个项目玩,有些算法的学习,基本都记录在博客文章里了。从一开始的抄代码,渐渐也能自己写点,有点思考,还能把自己对一些问题的理解分享出去。
25年展望
希望下学期能写一篇论文出来,先解决毕业的要求。不过具体的细分的方向难以确定,资料与详细的教程也匮乏,碰到一个小问题都可能得花好久才能解决,也有可能解决不了了,只能就此终止。买了书来看之后,有些源码还能用
机器学习深度学习方面的内容,还相对好搞定,网上开源的资源很多,我也能问我的本科同学,他们也有人在弄这个。
深度学习结合生物信息我一时还搞不太定,找相关论文复现,看过很多论文,人家压根不提供代码。作者只要不提供代码,就无从复现。
说实话,我也没有多大把握在期限内做成它。现在只能先学着深度学习的内容,学着那些理论知识,学习人家设计的算法代码,看一下陈铭老师的生物信息学,了解一下整个的生物信息学架构。
如果上面的目标达成了,我也想参与到项目中去
咱们实验室能测DNA序列吗?鸟枪法测的吗?【基因方向】
我做了个调研,AlphaFold已经解决了从氨基酸序列到三维结构的预测问题,但其背后的蛋白质折叠机制仍未完全被解开【蛋白质方向】
蛋白质折叠问题目前主要包括两个难点:
如何从氨基酸序列中预测蛋白质的三维结构?
为什么特定序列会折叠成特定的三维结构?
最后,借用教员的一段话激励自己和那些在迷茫中砥砺前行的同志们。
不要被敌人的气势汹汹所吓倒,
不要对尚能忍耐的困难所沮丧,
不要被一时的困难所灰心,
道路是曲折的,
前途是光明的,
黑暗即将过去,
曙光就在眼前,
有利的条件和主动的恢复,
产生于再坚持一下的努力之中!——教员