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RSS订阅原创 WDL脚本实战（一）-工作流、程序体、语法检查、输入输出及运行
WDL是由Broad Institute开发的一种生物信息流程开发语言，与传统的shell流程相比，具有复用性好、支持多种集群架构、便于多任务并行等优势，初次接触，写了个简易流程试水。1.WDL参考资料WDL语言的一些基本概念可参考以下教程：Cromwell +WDL学习：https://blog.csdn.net/qq_41551450/article/details/93486438GATK Cromwell +WDL学习：https://blog.csdn.net/theomarker/ar
2021-11-28 14:55:20
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原创 ggradar绘制多边形雷达图
用R语言绘制雷达图，尝试了三种工具：fmsb、echarts4r和ggradar，前两种绘制的是多边形雷达图，但导出比较麻烦。ggradar默认绘制的是圆形雷达图，这里用分组的方法重新绘制了图形边界，最终成果如下：...
2020-07-06 22:43:04
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原创 无参转录组GO、KEGG富集分析——diamond+idmapping+GOstats
准备（1）用无参转录组分析软件得到unigene fasta文件，命名为my_unigenes.fa，格式如下表所示：>MSTRG.5.1 gene=MSTRG.5TGATGTCATCGATCCGTGACGTTTAGTATTCAACCAATAGGAATCAACCACGTAGGATTGGCGATCCTCGTCAAACGTGTAAACGGTAGATCTGAACCGTTGACTGGC...
2018-03-29 18:54:19
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原创 HISAT2-StringTie-Ballgown有参转录组数据分析
参考文献：Pertea M, Kim D,Pertea G M, et al. Transcript-level expression analysis of RNA-seq experimentswith HISAT, StringTie and Ballgown.[J]. Nature Protocols, 2016, 11(9):1650. 1.clean reads质量检验：...
2017-07-05 09:36:40
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空空如也
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