学习药物设计入门案例---分子对接(Autodock)
1.从file里面读取大分子受体蛋白4zau.pdb,在edit里面加氢,去水,计算电荷,设置原子类型ASSIGN AD4,去水,最后保存为PDBQT的格式。1.PDBQT的格式。2.从ligand里面open小分子配体azd9291.pdb.弹出提示框点击确定。然后在ligand里面choose该配体。接下来判定配体的root。ADT菜单栏:Ligand->Torsion Tree->Detect Root,选择配体可扭转的键。Ligand->Torsion Tree->
原创
2022-02-16 10:21:06 ·
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