mapreduce 压缩

Hadoop的常见压缩格式以及特性


为了支持多种压缩解压缩算法,Hadoop引入了编码/解码器。与Hadoop序列化框架类似,编码/解码器也是使用抽象工厂的设计模式。目前,Hadoop支持的编码/解码器如下所示


hadoop下各种压缩算法的压缩比,压缩时间,解压时间见下表:

压缩算法原始文件大小压缩后的文件大小压缩速度解压缩速度
gzip8.3GB1.8GB17.5MB/s58MB/s
bzip28.3GB1.1GB2.4MB/s9.5MB/s
LZO-bset8.3GB2GB4MB/s60.6MB/s
LZO8.3GB2.9GB49.3MB/S74.6MB/s






压缩格式 split native 压缩率 速度 是否hadoop自带 linux命令 换成压缩格式后,原来的应用程序是否要修改
gzip很高比较快是,直接使用和文本处理一样,不需要修改
lzo比较高很快否,需要安装需要建索引,还需要指定输入格式
snappy比较高很快否,需要安装没有和文本处理一样,不需要修改
bzip2最高是,直接使用和文本处理一样,不需要修改


1 gzip压缩

优点:压缩率比较高,而且压缩/解压速度也比较快;hadoop本身支持,在应用中处理gzip格式的文件就和直接处理文本一样;有hadoop native库;大部分linux系统都自带gzip命令,使用方便。

缺点:不支持split。

应用场景:当每个文件压缩之后在130M以内的(1个块大小内),都可以考虑用gzip压缩格式。譬如说一天或者一个小时的日志压缩成一个gzip 文件,运行mapreduce程序的时候通过多个gzip文件达到并发。hive程序,streaming程序,和java写的mapreduce程序完 全和文本处理一样,压缩之后原来的程序不需要做任何修改。

2 lzo压缩

优点:压缩/解压速度也比较快,合理的压缩率;支持split,是hadoop中最流行的压缩格式;支持hadoop native库;可以在linux系统下安装lzop命令,使用方便。

缺点:压缩率比gzip要低一些;hadoop本身不支持,需要安装;在应用中对lzo格式的文件需要做一些特殊处理(为了支持split需要建索引,还需要指定inputformat为lzo格式)。

应用场景:一个很大的文本文件,压缩之后还大于200M以上的可以考虑,而且单个文件越大,lzo优点越越明显。

3 snappy压缩

优点:高速压缩速度和合理的压缩率;支持hadoop native库。

缺点:不支持split;压缩率比gzip要低;hadoop本身不支持,需要安装;linux系统下没有对应的命令。

应用场景:当mapreduce作业的map输出的数据比较大的时候,作为map到reduce的中间数据的压缩格式;或者作为一个mapreduce作业的输出和另外一个mapreduce作业的输入。

4 bzip2压缩

优点:支持split;具有很高的压缩率,比gzip压缩率都高;hadoop本身支持,但不支持native;在linux系统下自带bzip2命令,使用方便。

缺点:压缩/解压速度慢;不支持native。

应用场景:适合对速度要求不高,但需要较高的压缩率的时候,可以作为mapreduce作业的输出格式;或者输出之后的数据比较大,处理之后的数据 需要压缩存档减少磁盘空间并且以后数据用得比较少的情况;或者对单个很大的文本文件想压缩减少存储空间,同时又需要支持split,而且兼容之前的应用程 序(即应用程序不需要修改)的情况。

hadoop各种压缩算法的优缺点简述

在考虑如何压缩那些将由MapReduce处理的数据时,考虑压缩格式是否支持分割是很重要的。考虑存储在HDFS中的未压缩的文件,其大小为1GB,HDFS的块大小为64MB,所以该文件将被存储为16块,将此文件用作输入的MapReduce作业会创建1个输人分片(split ,也称为“分块”。对于block,我们统一称为“块”。)每个分片都被作为一个独立map任务的输入单独进行处理。

现在假设。该文件是一个gzip格式的压缩文件,压缩后的大小为1GB。和前面一样,HDFS将此文件存储为16块。然而,针对每一块创建一个分块是没有用的,因为不可能从gzip数据流中的任意点开始读取,map任务也不可能独立于其他分块只读取一个分块中的数据。gzip格式使用DEFLATE来存储压缩过的数据,DEFLATE将数据作为一系列压缩过的块进行存储。问题是,每块的开始没有指定用户在数据流中任意点定位到下一个块的起始位置,而是其自身与数据流同步。因此,gzip不支持分割(块)机制。

在这种情况下,MapReduce不分割gzip格式的文件,因为它知道输入是gzip压缩格式的(通过文件扩展名得知),而gzip压缩机制不支持分割机制。这样是以牺牲本地化为代价:一个map任务将处理16个HDFS块。大都不是map的本地数据。与此同时,因为map任务少,所以作业分割的粒度不够细,从而导致运行时间变长。

在我们假设的例子中,如果是一个LZO格式的文件,我们会碰到同样的问题,因为基本压缩格式不为reader提供方法使其与流同步。但是,bzip2格式的压缩文件确实提供了块与块之间的同步标记(一个48位的PI近似值),因此它支持分割机制。

对于文件的收集,这些问题会稍有不同。ZIP是存档格式,因此它可以将多个文件合并为一个ZIP文件。每个文件单独压缩,所有文档的存储位置存储在ZIP文件的尾部。这个属性表明ZIP文件支持文件边界处分割,每个分片中包括ZIP压缩文件中的一个或多个文件。

hadoop支持Splittable压缩lzo

在hadoop中使用lzo的压缩算法可以减小数据的大小和数据的磁盘读写时间,在HDFS中存储压缩数据,可以使集群能保存更多的数据,延长集群的使用寿命。不仅如此,由于mapreduce作业通常瓶颈都在IO上,存储压缩数据就意味这更少的IO操作,job运行更加的高效。

但是在hadoop上使用压缩也有两个比较麻烦的地方:第一,有些压缩格式不能被分块,并行的处理,比如gzip。第二,另外的一些压缩格式虽然支持分块处理,但是解压的过程非常的缓慢,使job的瓶颈转移到了cpu上,例如bzip2。

如果能够拥有一种压缩算法,即能够被分块,并行的处理,速度也非常的快,那就非常的理想。这种方式就是lzo。

lzo的压缩文件是由许多的小的blocks组成(约256K),使的hadoop的job可以根据block的划分来split job。不仅如此,lzo在设计时就考虑到了效率问题,它的解压速度是gzip的两倍,这就让它能够节省很多的磁盘读写,它的压缩比的不如gzip,大约压缩出来的文件比gzip压缩的大一半,但是这样仍然比没有经过压缩的文件要节省20%-50%的存储空间,这样就可以在效率上大大的提高job执行的速度。

hadoop下lzo配置文档参考http://www.tech126.com/hadoop-lzo/

如何在MapReduce中使用压缩

对于MapReduce 上的输入文件,TextInputFormat会自动识别是否是压缩文件,并进行解压,所以可以与普通文件进行完全相同的 处理。

对与输出文件,如果要进行压缩,需要对run()函数中的配置变量Configuration conf进行如下设置:

conf.setBoolean("mapred.output.compress", true);                  //启用输出文件压缩

conf.setClass("mapred.output.compression.codec", GzipCodec.class, CompreissionCodec.class);              //选择压缩器

本地压缩库

考虑到性能,最好使用一个本地库(native library)来压缩和解压。例如,在一个测试中,使用本地gzip压缩库减少了解压时间50%,压缩时间大约减少了10%(与内置的Java实现相比较)。表4-4展示了Java和本地提供的每个压缩格式的实现。井不是所有的格式都有本地实现(例如bzip2压缩),而另一些则仅有本地实现(例如LZO)。

 压缩格式 Java实现 本地实现
 DEFLATE 是 是
 gzip 是 是
 bzip2 是 否
 LZO 否 是

 

 

 

 

Hadoop带有预置的32位和64位Linux的本地压缩库,位于库/本地目录。对于其他平台,需要自己编译库,具体请参见Hadoop的维基百科http://wiki.apache.org/hadoop/NativeHadoop。

本地库通过Java系统属性java.library.path来使用。Hadoop的脚本在bin目录中已经设置好这个属性,但如果不使用该脚本,则需要在应用中设置属性。

默认情况下,Hadoop会在它运行的平台上查找本地库,如果发现就自动加载。这意味着不必更改任何配置设置就可以使用本地库。在某些情况下,可能希望禁用本地库,比如在调试压缩相关问题的时候。为此,将属性hadoop.native.lib设置为false,即可确保内置的Java等同内置实现被使用(如果它们可用的话)。

Hadoop压缩API应用实例

http://blog.csdn.net/wisgood/article/details/14451273
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