SIR模型由Kermack和McKendrick于1927年提出，用于描述传染病传播。模型分为易感者(S)，感染者(I)和康复者(R)三类。SIR模型通过常微分方程表示传播率(β)和康复率(γ)。R0是基本感染数，当R0>1时，疾病可能爆发。模型变体包括SI、SIS、SIRS和SEIR等。确定性模型和随机性模型各有特点，随机模型能更好地模拟复杂情况。本文将展示R语言在SIR模型应用中的实践。
此文用于整理回顾写论文时看的文献资料和学到的知识，也希望能带来一些参考。
什么是SIR模型？
1927年，Kermack 和 McKendrick 为了研究17世纪肆虐伦敦的黑死病和20世纪席卷孟买的鼠疫而发展出的仓室模型（compartmental model）就是现在被广泛应用的SIR模型。其中S代表Susceptible 易感者，I 代表 Infectious 感染者，R代表Recovered/Removed 康复者/移除者。之间的关系可用下图描述，SIR的模型建立在人口不变即无出生无死亡无移民的情况下，并且人口均匀混合在一起（homogeneous mixing。假设总人口为 N N N,那么 N = S + I + R N=S+I+R N=S+I+R.
这三种状态可用常微分方程表示为
d S d t = − β S I \frac{dS}{dt}= - \beta S I dtdS=−βSI
d I d t = β S I − γ
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