这篇博客介绍了如何使用MATLAB中的REST和RESTplus软件，以及wfu_pickatlas工具来创建脑区域掩膜（mask）。通过REST的viewer部分设置阈值，可以得到特定脑区，如脑岛。而wfu_pickatlas提供了一个直观的方式，选择AAL模板并保存脑区，如右脑岛（nsula_R）和左脑岛（insula_L）的掩膜。
做掩膜有很多种方法，可以自己写程序（当然我不会，哪位仁兄可以指点我一下），也可以借助已有的软件包。
- REST
这个是FMRI处理比较早期的一个软件，最新的是RESTplus，我把REST和RESTplus都下载了，事实证明好像一样。
（好久没写，我还去查了查怎么上传图片，废了老鼻子劲，居然拖过来就好了，我？？黑人问号脸，他喵的）
以上就是REST和RESTplus的打开界面，个人感觉新的还不如旧的显得高级。
现在用到的是viewer部分：
underlay下放的是ch2bet.nii，overlay下放的是aal.nii，结果是这样子：
如果你想要一个固定的脑区，就可以点击Misc，然后set range of threshold
比如29 to 30，就可以划分出左右脑岛，然后save cluster 就好了。
- wfu_pickatlas（简直神器）
直接在主页面打开，就是酱紫：
选择Human atlas后，点击aal(AAL是一个脑区模板)，就会出来所有脑区的名称，比如我想要脑岛的模板，就点击nsula_R和insula_L :
点击save mask就完成了。
附：wfu pickaltas下载地址：https://www.nitrc.org/projects/wfu_pickatlas/
REST下载地址：http://restfmri.net/forum/index.php?q=rest
本文完，期待下一次会写什么~~~
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