linux
文章平均质量分 66
紫色星寂
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
2020-09-11
xargs 是给命令传递参数的一个过滤器,也是组合多个命令的一个工具。 xargs 可以将管道或标准输入(stdin)数据转换成命令行参数,也能够从文件的输出中读取数据。 xargs 也可以将单行或多行文本输入转换为其他格式,例如多行变单行,单行变多行。 xargs 默认的命令是 echo,这意味着通过管道传递给 xargs 的输入将会包含换行和空白,不过通过 xargs 的处理,换行和空白将被空格取代。 xargs 是一个强有力的命令,它能够捕获一个命令的输出,然后传递给另外一个命令。 之所以能转载 2020-09-11 15:56:27 · 64 阅读 · 0 评论 -
Linux后台运行命令的方法
Linux后台运行命令的方法 1、nohup 用法: nohup command &# 这种是最基础的后台运行的命令,一般会默认生成一个nohup.out的日志文件,存储运行过程。如果没有放个后台的话是会直接在控制台打印出来的。当然,有的命令不会记录过程,也就没有这个日志文件。 如果要指定日志文件的名字的话,运行下面的命令即可:myout.file就是文件名 nohup command > myout.file 2>&1 & 当command中也有一个 “>”原创 2020-08-13 23:31:08 · 229 阅读 · 0 评论 -
GATK BaseRecalibrator报错”The contig order in dbsnp_138.hg38.vcf and reference is not the same“
GATK BaseRecalibrator报错”The contig order in dbsnp_138.hg38.vcf and reference is not the same“ 首先,用 picard 中的SortVcf将dbsnp_138.hg38.vcf根据参考基因组排序 picard SortVcf -I dbsnp_138.hg38.dic.vcf -O order_dbsnp_138.hg38.vcf -SEQUENCE_DICTIONARY hg38.dict 如果报错为“java原创 2020-08-12 19:45:18 · 679 阅读 · 0 评论