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生物信息学
zhanghongyi_cpp
臣提瓦特人,喜原甚
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试验二数据整理
删除合并后数据中的缺失值,并“weight“变量名更改成你的名字,并将更改后数据保存成EXCEL文件;调用R内置数据ChickWeight,并将该数据与问题1中模拟的数据合并;假设表中数据均服从正态分布,请模拟出表中数据的观测值并组成数据框;尝试在合并数据中提取子集、排序查看数据结构等操作。原创 2024-04-13 23:54:23 · 173 阅读 · 0 评论 -
r语言基本操作1——r语言基本操作
r语言作为一种常用于数据处理领域语言,较为广泛使用的是其对数据进行操作的功能,基础包括变量赋值、数据类型、数据导出和导入等,更深层次还包括统计相关函数、库函数调用、数据整合整理等,在r语言中也有很多第三方包,类似于python的库函数,在特定情况下可以被调用并完成特定操作。原创 2024-04-09 21:26:07 · 1644 阅读 · 0 评论 -
r语言大作业——基因表达矩阵分析
(1)利用主成分分析(PCA)对基因表达矩阵进行降维,并绘制PCA图。(2)筛选在所有样本中表达值均大于0的所有基因。(3)做聚类分析并绘制基因表达热图。原创 2024-03-20 09:02:45 · 462 阅读 · 0 评论 -
r语言大作业1——编写程序,从常用的生物信息学数据库中(如NCBI、TCGA等)批量下载数据。
内容集成自网络,部分经调试修改后发布。原创 2024-03-19 13:35:02 · 604 阅读 · 0 评论 -
生信相关工具的安装
bwa软件是基于linux的一种在生物信息学中用于基因组的比对的命令行软件,他没有用户窗口,是基于命令行命令运行的一款软件。2.将fq转换为sam。原创 2023-09-14 22:54:56 · 354 阅读 · 0 评论 -
虚拟机的安装与使用
虚拟机晕在平台一般使用VMware,VMware分为VMware pro 和VMware player,笔者认为VMware player免费且更加简单易用,更适合新手适用。在该文章中,文章的作者为我们提供了虚拟机以及xitongiso文件的下载源。原创 2023-09-14 22:34:21 · 69 阅读 · 0 评论