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原创 国内conda环境安装首选Miniconda3:解决Solving environment。。。

Miniconda3相对Anaconda3非常简化,特别适合,Anaconda3自带的软件包,99%以上你用不上,真用上哪个,直接conda/mamba install即可。Anaconda3自带很多软件包,在后续使用过程中,每安装一次其他新软件包都会检查一次环境,总是卡在Solving environment。后面再安装什么软件包或者创建什么环境,直接使用mamba,使用很顺畅,无需改变conda国内镜像源。直接去Home删掉Anaconda3这个文件夹,重新打开终端,下载Miniconda3进行安装。

2023-01-02 23:33:42 961 1

原创 傻瓜式下载SRA中的fastq双末端源数据

SRA的fastq双末端源文件下载。

2022-01-19 00:14:04 2096

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2020-09-03 10:57:07 6642 5

原创 解决metawrap:BLAST Database error: Error: Not a valid version 4 database的问题。

解决metawrap:BLAST Database error: Error: Not a valid version 4 database的问题。在使用metawrap 1.3.0 进行分类分析的时候,blobology,classify_bins这些模块的时候,需要用到blastn比对nt的数据库,如果出现这个提示说明你下载了新版本的nt数据库,而这个数据库的比对,需要blast+ 2.8以上的版本,而metawrap所携带的版本是2.2.28+,无法使用version 5的nt数据库。因此,解决这

2020-08-28 15:14:06 4930 1

原创 解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0/libncurses.so.5的问题

**解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0/libncurses.so.5的问题**一般这个问题出现是用conda环境直接安装才出现的:conda install samtools然后运行samtools会提示:samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object

2020-08-26 11:04:55 14623 5

空空如也

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