ZOJ1076-Gene Assembly

基因序列比对算法

最新推荐文章于 2022-12-08 16:04:17 发布

原创最新推荐文章于 2022-12-08 16:04:17 发布 · 297 阅读

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本文介绍了一种基于C++实现的基因序列比对算法，通过定义基因结构体并使用比较函数进行排序，实现了对基因序列的高效处理。该算法首先读取基因序列的数量和具体信息，然后对基因序列按结束位置进行排序，最后输出最长的不重叠基因序列。这种方法在生物信息学中具有广泛的应用，尤其是在基因组学研究中。

#include <stdio.h>
#include <algorithm>
#include <iostream>
using namespace std;

int n;
struct gene
{
	int start, end, pos;
}seq[1000];

bool cmp(gene a, gene b)
{
	if (a.end<b.end) return true;
	return false;
}

int main()
{
	while(scanf("%d", &n) && n)
	{
		for(int i = 0; i < n; i++)
		{
			seq[i].pos = i + 1;
			scanf("%d%d", &seq[i].start, &seq[i].end);
		}
		sort(seq, seq+n, cmp);
		int preEnd = seq[0].end;
		printf("%d", seq[0].pos);
		for(int i = 0; i < n; i++)
			if(seq[i].start > preEnd)
			{
				preEnd = seq[i].end;
				printf(" %d", seq[i].pos);
			}
		printf("\n");
	}
	return 0;
}