Gene Assembly(贪心,简单)

该博客探讨了在大量基因DNA序列数据中寻找基因的问题,特别是对于真核生物,由于存在打断基因编码区域的非编码DNA(垃圾DNA)。基因由多个称为外显子的编码区域组成,这些外显子在蛋白质合成过程中保持顺序。算法通常分为两步:寻找可能的外显子,然后组装最大可能的基因链,找到按顺序排列的最大外显子数。博客提供了一个实例,解释了输入和输出格式,并提出了寻找最大外显子链的问题。
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1076 - Gene Assembly

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问题描述

Gene Symbol是HGNC数据库为基因提供的官方名称,通常由大写字母和数字组成。它是按照基因的功能命名的,并且是基因命名的国际标准。在HGNC数据库中,可以通过基因的Official Symbol来查找基因的相关信息。例如,TP53基因的Official Symbol就是由HGNC所提供的名称。 在进行基因分析和后续处理时,有时需要将Ensembl ID或UniProt ID转换为Gene Symbol。Ensembl ID是Ensembl数据库中给基因分配的唯一标识符,而UniProt ID是UniProt数据库中给基因分配的唯一标识符。可以使用相应的转换工具或数据库文件,如Ensembl网站上的“Homo_sapiens.GRCh38.84.chr.gtf”文件,来将Ensembl ID转换为Gene Symbol。同样地,可以使用NCBI数据库或UniProt数据库来查找基因的相关信息,包括Gene Symbol。 综上所述,Gene Symbol是HGNC数据库为基因提供的官方名称,Ensembl ID和UniProt ID则是用于标识基因的唯一标识符。可以通过相应的数据库或转换工具来查询和转换基因的相关信息。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* *2* [gene ID / Gene Symbol / Ensembl ID](https://blog.csdn.net/weixin_53682198/article/details/130600052)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] - *3* [常见4种基因ID如何区别?如何转换?](https://blog.csdn.net/weixin_59289660/article/details/126178691)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] [ .reference_list ]
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