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获得Soot
你可以从Soot官方下载页面下载最近发布的Soot版本，有许多不同的版本可供你选择，但通常你只需下载像下面这样形式的版本：
- soot-x.y.z.jar
在这里，我们使用Soot 2.5.0 ，下载好之后我们先试一下：
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main
Soot version 2.5.0
Copyright (C) 1997-2010 Raja Vallee-Rai and others.
All rights reserved.
...
你们中间那些勇敢的人可以下载 Technische University Darmstadt大学的Secure Software Engineering Group提供的nightly build版本的Soot。通常最新的nightly build版本的Soot是最稳定的，因为在发布之前我们对其代码进行了测试。但这有时候并不全对。从
The Soot webpage可以下载nightly build版本的Soot。
Soot的命令行
好了，现在我们应该怎么做呢？先看一下命令行选项：
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main --help
General Options:
-coffi Use the good old Coffi front end for parsing
Java bytecode (instead of using ASM).
-h -help Display help and exit
-pl -phase-list Print list of available phases
-ph PHASE -phase-help PHASE Print help for specified PHASE
-version Display version information and exit
-v -verbose Verbose mode
...
处理单一文件
Soot通常可以处理许多类文件，这些类可以是下面这三种格式：
1. Java源代码 即 Java文件
2. Java字节码 即 类文件（class文件）
3. Jimple 代码 即 jimple文件
如果你还不大清楚，Jimple是Soot里最基本的中间表示（primary intermediate representation），它是一种三地址代码（three-address code），基本上是Java的简化版本，只需要约15种不同的表述（statements）。你可以使用Soot将 .java或 .class文件转换成 .jimple文件或者反过来。你甚至可以使用Soot从 .java文件生成 .jimple文件，然后使用普通的文本编辑器修改 .jimple文件，接着将修改后的 .jimple文件转换成 .class文件，手工优化你的程序。有点跑题了。。。
使用Soot处理类文件A和B最基本的方法是将它们添加到命令行，使类A和B成为 application classes(译者注：application classes是Soot里描述的class的一种，总共三种：arguments class、application class、library class):
$ ls *.java
A.java B.java
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main A B
Soot started on Thu Aug 21 08:26:41 GMT-05:00 2014
Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: couldn't find class: A (is your soot-class-path set properly?)</code>运行之后，出现问题了，对了，忘了最重要的一点：Soot有它自己的类路径
Soot 的classpath
Soot有自己的类路径，并且只从这个类路径下的jar包或目录读取文件。默认情况下，这个路径是空的，因此在上面这个例子中Soot没有找到类A和类B，尽管它们是存在的。所以，我们添加当前目录
" . "：
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -cp . A B
Soot started on Thu Aug 21 08:32:13 GMT-05:00 2014
Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: couldn't find class: java.lang.Object (is your soot-class-path set properly?)
为什么Soot如此关心
java.lang.Object呢？为了对你的程序做些有意义的事情，Soot需要类型信息，尤其需要对局部变量重新构造类型。为了达到这个目的，Soot需要知道你想要处理的类的完整类型继承关系。
针对这个异常，有三种解决方法：
1. 将
rt.jar 添加到你的classpath
2. 添加
-pp 选项，此时假设你的
CLASSPATH 变量已经包含
rt.jar 或者
JAVA_HOME 已经被正确设置
3. 使用
-allow-phantom-refs 选项（不推荐）
第一种方法，将JDK的
rt.jar 添加到Soot的calsspath (不是JVM的classpath)。这个jar包包含
java.lang.Object 类
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -cp .:/home/user/ebodde/bin/sun-jdk1.6.0_05/jre/lib/rt.jar A B
Soot started on Thu Aug 21 08:42:09 GMT-05:00 2014
Transforming B...
Transforming A...
Writing to sootOutput/B.class
Writing to sootOutput/A.class
Soot finished on Thu Aug 21 08:42:12 GMT-05:00 2014
Soot has run for 0 min. 3 sec.
要注意，一个普遍的问题可能会像下面一样：
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -cp .:~/bin/sun-jdk1.6.0_05/jre/lib/rt.jar A B
Soot started on Thu Aug 21 08:43:43 GMT-05:00 2008
Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: couldn't find class: java.lang.Object (is your soot-class-path set properly?)
第二个方法是使用
-pp：
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -cp . -pp A B Soot started on Thu Aug 21 08:47:42 GMT-05:00 2008
Transforming A...
Transforming B...
Writing to sootOutput/A.class
Writing to sootOutput/B.class
Soot finished on Thu Aug 21 08:47:46 GMT-05:00 2008
Soot has run for 0 min. 3 sec.
1. 你当前的
CLASSPATH 变量的内容
2.
${JAVA_HOME}/lib/rt.jar
3. 如果你是在整个程序范围内模式（whole-program mode）运行（即
-w 选项被启用），那么Soot会自动添加
${JAVA_HOME}/lib/jce.jar
第三个让Soot运行的方法是使用
-allow-phantom-refs 选项：
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -allow-phantom-refs -cp . A B
Soot started on Thu Aug 21 08:52:35 GMT-05:00 2008
Warning: java.lang.Short is a phantom class!
Warning: java.lang.Class is a phantom class!
Warning: java.lang.Character is a phantom class!
...
Transforming B...
Transforming A...
Writing to sootOutput/B.class
Writing to sootOutput/A.class
Soot finished on Thu Aug 21 08:52:37 GMT-05:00 2008
Soot has run for 0 min. 1 sec.
对于Windows用户要注意一点：Soot会正确对待驱动器号，但在Windows下的路径分隔符必须是一个反斜杠，而不是正斜杠。
处理整个目录
你可以使用 Soot里的
-process-dir 选项处理 整个目录或jar文件
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -cp . -pp -process-dir .
Soot started on Thu Aug 21 09:01:12 GMT-05:00 2014
Transforming A...
Transforming B...
Writing to sootOutput/A.class
Writing to sootOutput/B.class
Soot finished on Thu Aug 21 09:01:15 GMT-05:00 2014
Soot has run for 0 min. 3 sec.
处理jar文件的时候，使用同样的选项，但此时需要提供jar文件的路径而不是jar文件所在的目录。很不错不是吗？不过要注意：如果你对同一个文件夹再次执行（连续执行）相同的命令，你会遇到下面的问题：
$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -cp . -pp -process-dir .
Soot started on Thu Aug 21 09:02:29 GMT-05:00 2008
Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: Error: class A read in from a classfile in which sootOutput.A was expected.$ java -cp soot-2.5.0.jar soot.Main -cp . -pp -process-dir . -d /tmp/sootout
Soot started on Thu Aug 21 09:06:29 GMT-05:00 2008
Transforming A...
Transforming B...
Writing to /tmp/sootout/A.class
Writing to /tmp/sootout/B.class
Soot finished on Thu Aug 21 09:06:32 GMT-05:00 2008
Soot has run for 0 min. 2 sec.
处理特定文件（.class / .java/ ,jimple）
假设你有一个目录，里面既包含
A.java 又包含
A.class，你像之前那样调用soot，这时Soot会从 A.class 文件读取A的定义，这可能不是你一直想要的。
-src-prec 选项告诉soot它应该优先处理哪种输入的类型。总共有四个选项：
1.
c 或者
class（默认）：优先处理class文件
2.
only-class ：只处理class文件
3.
J 或者
jimple ：优先处理jimple文件
4.
java ：优先处理java文件
因此，在上面这个例子中，如果指定
-src-prec java 那么会装载 A.java。
应用程序类与库类（Application classes vs. library class）
Soot实际处理的类称为
application class，这与
library classes恰好相反，soot不处理library class，只把他们用来类型解析。Application classes通常显示的指定在命令行里或者那些通过
-process-dir 命令指定的目录下的类。
当你使用
-app 选项时，Soot也会处理由application class所引用的所有的类，然而，它不会处理JDK中的任何类，即那些位于
java.* 和
com.sun.* 包下的类，如果你希望包含这些类，那么可以使用特殊的
-i 选项，比如
-i java 。更多关于命令行选项的操作请看
Soot 命令行选项。
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