HPL+Openmpi+GOTOBLAS2

HPL+Openmpi+GOTOBLAS2

终于成功了！！！

废话:之前mpi安装的有问题，编译完之后不能mpirun真的让人头大。。于是我就卸载了之前安装的mpich和lam4-dev,然后安装了openmpi

本篇参照：这个博客

Openmpi的安装

• 解压tar -zxvf openmpi-3.1.0.tar.gz
• 系统配置cd openmpi-3.1.0
• 然后./configure --prefix=/opt/openmpi

※：/opt/openmpi是安装路径，打开之后应该有bin etc include lib share这几个文件夹

• 编译 make
• 安装make install
• 配置环境变量vim /etc/profile
• 添加：

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi/lib
export PATH=/opt/openmpi/bin:$PATH
export INCLUDE=/opt/openmpi/include:$INCLUDE

• 运行以下命令使得修改生效：

  source /etc/profile(或者source.bashrc)

安装GOTOBLAS2

由于官网的安装包找不到了，于是我在github上找到了一个mirror

• git clone到本地
• 进到cd gotoblas2文件夹中然后执行make BINARY=64 TARGET=NEHALEM 如果编译错误需make clean再make
  这里有个bug！！！我最后显示的有些问题，但也编译成功生成了libgoto2_nehalemp-r1.13.a
• 显示生成libgoto2_nehalemp-r1.13.a便达到了目的。

安装HPL

这里贴一个下载地址：http://www.netlib.org/benchmark/hpl/

• 解压下载的安装包tar -zxvf hpl-2.3.tar.gz

• 进入cd hpl-2.3文件

• 根据机器情况复制Makefile模板cd setup然后cp Make.Linux_PII_CBLAS ../Make.test

  这里把setup文件下的模板复制到上一层文件夹中，并重新命名为Make.test

• vim Make.test配置文件

这里直接贴上我的配置

# 
SHELL        = /bin/sh
#
CD           = cd
CP           = cp
LN_S         = ln -s
MKDIR        = mkdir
RM           = /bin/rm -f
TOUCH        = touch
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Platform identifier ------------------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
ARCH         = test
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - HPL Directory Structure / HPL library ------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
TOPdir       = /home/challow/nfs/hpl-2.3 # 这里的hpl是你下载的目录
INCdir       = $(TOPdir)/include
BINdir       = $(TOPdir)/bin/$(ARCH)
LIBdir       = $(TOPdir)/lib/$(ARCH)
#
HPLlib       = $(LIBdir)/libhpl.a 
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Message Passing library (MPI) --------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
MPdir        = /opt/openmpi # 如果参照上面的openmpi就安装在这里
MPinc        = -I$(MPdir)/include
MPlib        = $(MPdir)/lib/libmpi.so #!!!!这个东东
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Linear Algebra library (BLAS or VSIPL) -----------------------------
# ----------------------------------------------------------------------

LAdir        =  /home/challow/blas/gotoblas2 # gotoblas2下载的路径
LAinc        =  
LAlib        =  $(LAdir)/libgoto2_nehalemp-r1.13.a # 直接引用中间的包
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - F77 / C interface --------------------------------------------------

F2CDEFS      =
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - HPL includes / libraries / specifics -------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
HPL_INCLUDES = -I$(INCdir) -I$(INCdir)/$(ARCH) $(LAinc) $(MPinc)
HPL_LIBS     = $(HPLlib) $(LAlib) $(MPlib)
#
# - Compile time options -----------------------------------------------
#
HPL_OPTS     = -DHPL_CALL_CBLAS
#
# ----------------------------------------------------------------------
#
HPL_DEFS     = $(F2CDEFS) $(HPL_OPTS) $(HPL_INCLUDES)
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Compilers / linkers - Optimization flags ---------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
CC           = /opt/openmpi/bin/mpicc  # 这里还是根据openmpi安装的路径
CCNOOPT      = $(HPL_DEFS)
CCFLAGS      = $(HPL_DEFS) -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops
#
#
LINKER       = /opt/openmpi/bin/mpif77  # 这里也可以是mpicc
LINKFLAGS    = $(CCFLAGS)
#
ARCHIVER     = ar
ARFLAGS      = r
RANLIB       = echo
#
# ----------------------------------------------------------------------

※：上面的操作都是基于openmpi的，如果安装其他版本的MPI道理一样，不过在MPlib = $(MPdir)/lib/libmpi.so

做相应的更改！xxxx/libmpi.a或者xxxx/libmpichxx.a等等文件。

• 然后直接make arch=test即可！

编译完会在bin下面生成test文件夹，里面有HPL.dat xhpl两个文件。HPL.dat是运行的参数，这里可以自行修改。使用命令mpirun -np 4 ./xhpl就可以成功运行！

后语

这是一个锻炼的过程，安装过程可能各种报错。慢慢来，一个一个调就行！大不了卸载重来，哈哈。