GraphX入门简介

本文介绍了Spark GraphX作为分布式图处理框架的基本概念和应用背景,详细阐述了GraphX的框架,包括图存储模式(如点分割和边分割)、GraphX的存储模式以及图计算模式,如Pregel的BSP模型。通过实例展示了如何在GraphX中进行图的构建、操作和计算。
摘要由CSDN通过智能技术生成

GraphX入门

1.     GraphX应用背景

   Spark GraphX是一个分布式图处理框架,它是基于Spark平台提供对图计算和图挖掘简洁易用的而丰富的接口,极大的方便了对分布式图处理的需求。

众所周知·,社交网络中人与人之间有很多关系链,例如Twitter、Facebook、微博和微信等,这些都是大数据产生的地方都需要图计算,现在的图处理基本都是分布式的图处理,而并非单机处理。Spark GraphX由于底层是基于Spark来处理的,所以天然就是一个分布式的图处理系统。

图的分布式或者并行处理其实是把图拆分成很多的子图,然后分别对这些子图进行计算,计算的时候可以分别迭代进行分阶段的计算,即对图进行并行计算。下面我们看一下图计算的简单示例:


从图中我们可以看出:拿到Wikipedia的文档以后,可以变成Link Table形式的视图,然后基于Link Table形式的视图可以分析成Hyperlinks超链接,最后我们可以使用PageRank去分析得出Top Communities。在下面路径中的Editor Graph到Community,这个过程可以称之为Triangle Computation,这是计算三角形的一个算法,基于此会发现一个社区。从上面的分析中我们可以发现图计算有很多的做法和算法,同时也发现图和表格可以做互相的转换。

 

2.     GraphX的框架

 设计GraphX时,点分割和GAS都已成熟,在设计和编码中针对它们进行了优化,并在功能和性能之间寻找最佳的平衡点。如同Spark本身,每个子模块都有一个核心抽象。GraphX的核心抽象是Resilient Distributed Property Graph,一种点和边都带属性的有向多重图。它扩展了Spark RDD的抽象,有Table和Graph两种视图,而只需要一份物理存储。两种视图都有自己独有的操作符,从而获得了灵活操作和执行效率。


如同Spark,GraphX的代码非常简洁。GraphX的核心代码只有3千多行,而在此之上实现的Pregel模式,只要短短的20多行。GraphX的代码结构整体下图所示,其中大部分的实现,都是围绕Partition的优化进行的。这在某种程度上说明了点分割的存储和相应的计算优化,的确是图计算框架的重点和难点。

2.1.1图存储模式

l边分割(Edge-Cut):每个顶点都存储一次,但有的边会被打断分到两台机器上。这样做的好处是节省存储空间;坏处是对图进行基于边的计算时,对于一条两个顶点被分到不同机器上的边来说,要跨机器通信传输数据,内网通信流量大。

l点分割(Vertex-Cut):每条边只存储一次,都只会出现在一台机器上。邻居多的点会被复制到多台机器上,增加了存储开销,同时会引发数据同步问题。好处是可以大幅减少内网通信量。

 

2.1.2GraphX存储模式

Graphx借鉴PowerGraph,使用的是Vertex-Cut(点分割)方式存储图,用三个RDD存储图数据信息:

lVertexTable(id, data):id为Vertex id,data为Edge data

lEdgeTable(pid, src, dst, data):pid为Partion id,src为原定点id,dst为目的顶点id

lRoutingTable(id, pid):id为Vertex id,pid为Partion id

点分割存储实现如下图所示:

 


2.1.3图计算模式

    目前基于图的并行计算框架已经有很多,比如来自Google的Pregel、来自Apache开源的图计算框架Giraph/HAMA以及最为著名的GraphLab,其中Pregel、HAMA和Giraph都是非常类似的,都是基于BSP(Bulk Synchronous Parallell)模式。

BulkSynchronous Parallell,即整体同步并行,它将计算分成一系列的超步(superstep)的迭代(iteration)。从纵向上看,它是一个串行模式,而从横向上看,它是一个并行的模式,每两个superstep之间设置一个栅栏(barrier),即整体同步点,确定所有并行的计算都完成后再启动下一轮superstep。


每一个超步(superstep)包含三部分内容:

1.计算compute:每一个processor利用上一个superstep传过来的消息和本地的数据进行本地计算;

2.消息传递:每一个processor计算完毕后,将消息传递个与之关联的其它processors

3.整体同步点:用于整体同步,确定所有的计算和消息传递都进行完毕后,进入下一个superstep。

3.GraphX实例

3.1 图例演示

3.1.1 例子介绍

下图中有6个人,每个人有名字和年龄,这些人根据社会关系形成8条边,每条边有其属性。在以下例子演示中将构建顶点、边和图,打印图的属性、转换操作、结构操作、连接操作、聚合操作,并结合实际要求进行演示。


3.1.2 程序代码

import org.apache.log4j.{Level, Logger}

import org.apache.spark.{SparkContext, SparkConf}

import org.apache.spark.graphx._

import org.apache.spark.rdd.RDD

 

object GraphXExample {

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