玩水的张同学-CSDN博客

原创 PyMOL渲染

阅读本文需要15min1.找到小分子周围的残基2.将显示的残基新建为一个对象2.小分子单独设置为一个对象3.将残基显示为Sticks格式4.显示氢键：找到小分子对象5.氢键键长：找到自动生成的氢键对象6.修改标签大小7.隐藏标签：找到自动生成的氢键对象手动显示键长：Wizard—measurment—依次选择两个原子8.增强小分子的显示：小分子对象—S—as下图为几种格式显示9.标记氨基酸：选择相应残基对象拖动标签到相应位置：右下角点击Mouse mode.

2022-03-29 16:28:18 1364

原创分子模拟对接教程—带你从 0 到 1

阅读本文大概需要30分钟1. 软件安装1). 需要安装转件名称：AutoDock：http://autodock.scripps.edu/mgltools：http://mgltools.scripps.edu/downloadsOpenBabel：http://openbabel.org/wiki/Category:InstallationPyMOL：https://vina.scripps.edu/Python（3.0版本）上述安装包除PyMOL外均可免费安装，如果在相关论文中使用了.

2022-01-28 15:58:45 9662 10

原创 NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据

NCBI上传16S rRNA测序数据1.登陆NCBI官网NCBI官网链接2.选择上传序列类型上传16S rRNA测序数据，直接选16S rRNA就可以，然后弹出上传数据集的类型，选择SRA3.注册NCBI账号选择SRA后，会弹出如下的一些提示信息，直接选择submit即可；3.1 进入提交信息页面进入正式提交信息的页面；注意此处的“My submissions”选项，注册完账号后，仍需返回这里3.2 注册NCBI账号选择右上角的登陆账号—>选择ORCID登陆/注册（已经申请

2021-09-30 21:42:22 11065

原创 window 下载 SRA Toolkit 安装使用以及格式转化

SRA下载及安装1、简介SRA（Sequence ReadArchive）数据库是用于存储二代测序的原始数据，包括 454，Illumina，SOLiD，IonTorrent，Helicos 和 CompleteGenomics。除了原始序列数据外，SRA现在也存在raw reads在参考基因的比对信息。根据SRA数据产生的特点，将SRA数据分为四类：Studies-- 研究课题Experiments-- 实验设计Runs-- 测序结果集Samples-- 样品信息SRA中数据结构的层次关系

2021-09-10 16:32:21 11811 6

机器学习估算水中替代物的养分浓度_translate(1).pdf

连续的高频水质监测已成为支持水管理的一项关键任务。尽管传感器技术取得了进步，但是某些变量仍无法轻松地和/或经济地就地和实时地进行监控。在这些情况下，可以使用替代度量通过数据驱动模型进行估计。在这项工作中，通常使用就地测量的变量作为替代指标，以利用机器学习模型（特别是随机森林）来估算农村流域和城市流域中养分的浓度。将结果与使用相同数量的代理进行线性建模的结果进行比较，可将均方根误差（RMSE）降低多达60.1％。计算出包括多达七个替代传感器的收益，得出结论，就错误改善而言，在每个集水区分别增加四个以上和五个传感器是不值得的。

2020-04-08

保温层最优厚度计算

数学建模论文书写基本框架计算三层保温层中最中间保温层的厚度，通过简化边界条件和热导方程。

2018-09-16

模糊神经网络实现

对水质监测提供了可行的模糊神经网络算法，经过数据处理后，则可以精准预测

2018-09-14

空空如也

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