生物信息学
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生信人zexl
尽吾志也而不能至者,可以无悔矣
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GSVA基因集变异分析结合limma包分析差异基因集
gsva基因集变异分析,是一种非参数的无监督分析方法,主要用来评估芯片和转录组的基因集富集结果。通过将基因在不同样品间的表达量矩阵转化成基因集在样品间的表达量矩阵,从而来评估不同的代谢通路在不同样品间是否富集。简单来说就是研究这些感兴趣的基因集在不同样品间的差异,或者寻找比较重要的基因集。核密度估计秩统计量计算获取GSVA富集分数linear model...原创 2021-06-21 14:49:18 · 2436 阅读 · 0 评论 -
STAR建索引内存不够
STAR建索引内存不够,我们服务器100多G的内存居然不够,这是什么鬼,STAR版本STAR-2.5.2b。调整你的limitGenomeGenerateRAM参数就可以了。STAR--runThreadN 40--runMode genomeGenerate--genomeDir ./star_index--genomeFastaFiles GRCh38.p13.genome...原创 2019-12-20 16:27:08 · 5838 阅读 · 5 评论