qiime2
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竹舞清风_忆
念念不忘,必有回响
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qiita上传和分析16S rRNA数据
qiita(https://qiita.ucsd.edu/)是一个用于微生物组学研究的在线工具和资源库平台。本博客介绍了如何上传16S rRNA数据到qiita平台并对其进行分析。原创 2023-03-08 00:56:01 · 881 阅读 · 0 评论 -
利用qiime2分析微生物组16S rRNA数据小结
混合双端、V3-V4区域测序,00.RawData已经进行了样本拆分、barcode去除和引物切除。每个样本文件夹里有5个文件,第一个extendedfrags.fastq文件是拼接后的序列,raw_1fq.gz和raw_2.fq.gz是未去barcode和引物的双端序列;最后两文件是去掉引物和barcode后的原始数据。extendedFrags.fastq文件是由flash软件合并双端序列(即reads拼接)所得。处理过程:1. 导入数据1)创建文件列表seq-list.tsv文原创 2021-07-07 13:51:37 · 4528 阅读 · 6 评论