zyf_2014的博客

变量声明：Perl的变量使用特殊符号（如$、@、%）来标识其类型。例如，$表示标量（scalar）变量，@表示数组（array）变量，%表示哈希（hash）变量。循环结构：Perl提供了多种循环结构，如for、foreach、while、until等。条件语句：Perl支持常见的条件语句，如if、else、elsif、unless等。文件处理：Perl对文件处理提供了强大的支持，包括打开、读取、写入和关闭文件等操作。子程序：Perl中可以定义和调用子程序（也称为函数）来组织代码和实现可重用性。

【代码】R的一些奇奇怪怪的功能。

数据做图1. 散点图 (scatter plot)2. 柱状图 (bar plot)3. 堆积柱状图 (stacked bar chart)4. 热图 (heatmap)

qiita（https://qiita.ucsd.edu/）是一个用于微生物组学研究的在线工具和资源库平台。本博客介绍了如何上传16S rRNA数据到qiita平台并对其进行分析。

统计检验分析——t-test, Wilcoxon test, One way ANOVA, Kruskal-Wallis test

混合双端、V3-V4区域测序，00.RawData已经进行了样本拆分、barcode去除和引物切除。每个样本文件夹里有5个文件，第一个extendedfrags.fastq文件是拼接后的序列，raw_1fq.gz和raw_2.fq.gz是未去barcode和引物的双端序列；最后两文件是去掉引物和barcode后的原始数据。extendedFrags.fastq文件是由flash软件合并双端序列（即reads拼接）所得。处理过程：1. 导入数据1）创建文件列表seq-list.tsv文

准备工作（安装程序包并配置环境变量）：R软件：https://www.r-project.org/对应的Rtools：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/Miktex：https://miktex.org/R需要安装 Rcpp和RcppArmadillo程序包：https://cran.r-project.org/web/packages/Rcpp/index.htmlhttps://cran.r-project.org/w..