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文章平均质量分 67
半个馒头
这个作者很懒,什么都没留下…
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submit reads to NCBI
向NCBI提交数据是非常麻烦的事,它的要求非常高,而且还坚持一些不是标准的标准,下面是记录自己提交数据是的步骤,以备后用。一、submit reads1、prepare .fq data准备.fa格式的数据,这个其实平常用的就是,不是的话估计还是比较麻烦的。其格式如下:@FC61K87AAXX:6:1:1035:17969#0/2NNNNNNACAGCACAGNNNNNNNG原创 2012-02-26 10:11:58 · 2889 阅读 · 0 评论 -
submit assembly to NCBI
二、submit assembly to NCBI1、prepare data 首先要具有fasta格式数据(NO .gz),这是处理的基础,具体格式如下:>Scaffold633TCATTTCTCCACTCTCGATGAACAAATCTGGAGGGATTTTTTTTCATTCCACTCAATAGGTTGTCTATAAAGGTGTGATTCGTGGAACTTCTTCAC原创 2012-02-26 10:48:44 · 1895 阅读 · 0 评论 -
Nature:蛔虫病治疗新视野
作者:华大基因研究院来源:华大基因研究院 2011-10-29 12:09:37 2011年10月26日,由澳大利亚墨尔本大学和华大基因主导完成的猪蛔虫(Ascaris suum)基因组研究成果在国际顶尖杂志《自然》(Nature)上在线发表。该研究成果将有助于科学家从基因水平了解蛔虫病遗传特性及致病机理,为蛔虫病治疗药物和疫苗的研发奠定了重要的科研基础。寄生虫病是世转载 2012-04-11 14:28:35 · 635 阅读 · 0 评论 -
统计词汇
Absolutedeviation,绝对离差 Absolutenumber,绝对数 Absoluteresiduals,绝对残差 Accelerationarray,加速度立体阵 Accelerationinanarbitrarydirection,任意方向上的加速度 Accelerationnormal,法向加速度 Accelerationspacedimension,加转载 2012-04-16 13:51:15 · 1578 阅读 · 0 评论 -
blastall commands analysis
Blast,全称Basic Local Alignment Search Tool,即“基于局部比对算法的搜索工具”,由Altschul等人于1990年发布。Blast能够实现比较两端核酸或者蛋白序列之间的同源性的功能,它能够快速的找到两段序列之间的同源序列并对比对区域进行打分以确定同源性的高低。Blast的运行方式是先用目标序列建数据库(这种数据库称为database,里面的每一条序列称为s原创 2012-07-08 15:35:33 · 5058 阅读 · 0 评论 -
soap2结果分析
soap的结果分析:1) id of read2) full sequence of read. the read will be converted to the complementary if mapped on the reverse chain of the reference;3) quality of the sequence corresp原创 2012-07-01 14:25:20 · 1934 阅读 · 0 评论 -
The birth-death process
原创 2012-11-11 13:14:22 · 1356 阅读 · 0 评论