R语言-安装randomForest和ROCR包

最新推荐文章于 2024-07-24 19:56:38 发布

拾毅者

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分类专栏： R 文章标签：环境工具软件安装下载

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引文：为了跑一篇论文的实验，需要装R软件，安装R软件参考之前发布的一篇博文：CentOS下搭建R环境，下面介绍怎么安装R**randomForest**和ROCR两个工具包。

1.R3+版本安装包

1.1 randomForest包

下载链接地址：

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/randomForest/randomForest_4.6-7.tar.gz

在linux下无需解压，直接切换地址到下载的文件目录下，执行代码

R CMD INSTALL randomForest_4.6-7.tar.gz

1.2 ROCR包

ROCR依赖于gplots，所以要先安装gplots,而gplots依赖gtools，gdata，caTools,同时caTools还依赖bitops，所以安装顺序如下：
gtools下载
先下载各个工具包

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gtools/gtools_3.4.1.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gdata/gdata_2.13.3.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/bitops/bitops_1.0-5.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/caTools/caTools_1.17.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gplots/gplots_2.16.0.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/ROCR/ROCR_1.0-6.tar.gz

接着按照依赖循序依次安装包

R CMD INSTALL gtools_3.4.1.tar.gz
R CMD INSTALL gdata_2.13.3.tar.gz 
R CMD INSTALL bitops_1.0-5.tar.gz
R CMD INSTALL caTools_1.17.tar.gz
R CMD INSTALL gplots_2.16.0.tar.gz
R CMD INSTALL ROCR_1.0-6.tar.gz

如果你是R3+，到此可以结束了，已经安装完成。下面介绍R-2.10.1的安装和相应包的安装。

2.R-2.10.1版本及包的安装

2.1 下载R-2.10.1

wget -P ~/software/ http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-2/R-2.10.1.tar.gz

-P是指定路径的。

2.2 安装R-2.10.1

tar -zxvf R-2.10.1.tar.gz
cd R-2.10.1/
./configure --prefix=/home/work/R --enable-R-shlib
meke 
meke install

2.3 randomForest包安装

下载链接地址：

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/randomForest/randomForest_4.6-7.tar.gz

在linux下无需解压，直接切换地址到下载的文件目录下，执行代码

R CMD INSTALL randomForest_4.6-7.tar.gz

2.4 ROCR包的安装

依赖关系上面已经给出来了，只是有的依赖包的版本有区别，下面给出下载地址和安装方法
下载各个包

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gtools/gtools_3.4.1.tar.gz
wget  http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gdata/gdata_2.8.2.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/bitops/bitops_1.0-5.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/caTools/caTools_1.17.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gplots/gplots_2.8.0.tar.gz
wget  http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/ROCR/ROCR_1.0-3.tar.gz

安装

R CMD INSTALL gtools_3.4.1.tar.gz
R CMD INSTALL gdata_2.13.3.tar.gz 
R CMD INSTALL bitops_1.0-5.tar.gz
R CMD INSTALL caTools_1.17.tar.gz
R CMD INSTALL gplots_2.16.0.tar.gz
R CMD INSTALL ROCR_1.0-6.tar.gz