【解决】Spark运行时产生的临时目录的问题

最新推荐文章于 2023-11-07 21:16:14 发布
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当执行Spark SQL查询大量数据时，发现系统盘占用剧增，主要原因是 Spark 在 /tmp 目录下生成了大量临时文件。解决办法包括删除 /tmp/spark* 文件，以及修改 Spark 配置，指定多个不同的临时目录，如 /diskb/sparktmp 等，以分散存储需求，并在 spark-env.sh 中设置 SPARK_LOCAL_DIRS 环境变量。

今天，在执行spark-sql时，查询数据量超过1.7亿行，数据量大小38G，出现系统盘占用突然变高的情况，监控如下：


磁盘占用监控

检查为 /tmp 目录下，spark生成的临时目录占用了大量的磁盘空间，生成的spark临时文件超过15G了。


解决方案为：

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hadoop、spark使用问题汇总
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在之前的集群搭建中，我安装的是pyspark库是3.5.0版本，降低为3.2.0版本（我的spark安装包为3.2.0），该问题解决。自己可以进入那个目录看一下，里面会多一些文件（spark-xxxxx-xxxx），可以手动删掉，对集群运行没有影响，如果一直存储这些文件，c盘会变满，再运行集群会有问题。（有办法的可以交流以下）这个错误对代码的运行没有影响，具体可行修改方法没有查到（有需要可以自己搜索）。
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  大家好，我是不温卜火，是一名计算机学院大数据专业大二的学生，昵称来源于成语—不温不火，本意是希望自己性情温和。作为一名互联网行业的小白，博主写博客一方面是为了记录自己的学习过程，另一方面是总结自己所犯的错误希望能够帮助到很多和自己一样处于起步阶段的萌新。但由于水平有限，博客中难免会有一些错误出现，有纰漏之处恳请各位大佬不吝赐教！暂时只有csdn这一个平台，博客主页：https://buwenbuhuo.blog.csdn.net/   此篇为大家带来的是Spark 运行模式之Local本地模式。 .
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春华秋实
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Spark性能相关参数配置 http://spark-config.readthedocs.org/en/latest/ 随着Spark的逐渐成熟完善, 越来越多的可配置参数被添加到Spark中来, 在Spark的官方文档http://spark.apache.org/docs/latest/configuration.html 中提供了这些可配置参数中相当大一部分的说
使用scala编写spark任务，在华为云运行报错，说是因为file临时文件过多超过阈值了，怎么缩小临时文件个数
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11-12
<think>我们面对的问题是：Scala编写的Spark任务在华为云运行因临时文件过多超过阈值报错，需要缩小临时文件个数。 根据Spark的工作原理，临时文件通常由以下几个原因产生： 1. Shuffle操作（如groupByKey, reduceByKey, join等）会产生大量的中间数据，这些数据会写入磁盘。 2. 缓存（Cache）操作如果使用磁盘存储（如MEMORY_AND_DISK）也会产生临时文件。 3. 其他可能产生临时文件的操作，如检查点（Checkpoint）等。 因此，我们的优化方向是减少Shuffle产生的临时文件数量，以及调整缓存策略避免使用磁盘。 具体措施如下： 1. **减少Shuffle数据量**： - 在Shuffle之前，尽量使用`filter`过滤掉不需要的数据。 - 使用`reduceByKey`或`aggregateByKey`等可以在map端进行合并（combine）的操作，减少传输的数据量。 - 对于Join操作，可以考虑使用广播变量（Broadcast Variables）来避免Shuffle，特别是当一个小表和一个大表进行Join时，可以将小表广播到各个Executor。 2. **调整Shuffle分区数**： - 通过`spark.sql.shuffle.partitions`（对于DataFrame/DataSet）或`spark.default.parallelism`（对于RDD）来调整Shuffle的分区数。默认值通常为200，如果分区数过多，会导致产生大量小文件，增加临时文件数量。适当减少分区数（但也不能太少，以免影响并行度）可以合并小文件，从而减少文件数量。 - 注意：分区数过少会导致每个分区数据量过大，可能引起OOM，需要根据数据量权衡。 3. **使用高效的序列化格式**： - 使用Kryo序列化（`spark.serializer`设置为`org.apache.spark.serializer.KryoSerializer`）可以减少Shuffle数据的大小，从而减少写入磁盘的数据量。 4. **优化缓存策略**： - 如果内存充足，尽量使用内存缓存（如`MEMORY_ONLY`），避免使用磁盘。如果数据量太大，可以考虑增加Executor的内存，或者调整数据存储级别为`MEMORY_ONLY_SER`（序列化存储，节省空间但增加CPU开销）。 - 及时释放不再需要的缓存数据，使用`unpersist()`方法。 5. **调整临时目录配置**： - Spark的临时目录由`spark.local.dir`配置指定，默认是`/tmp`。可以配置多个磁盘路径（用逗号分隔）来分散IO压力，但并不能减少文件个数。不过，如果是因为单个磁盘空间不足，可以配置多个磁盘路径。 - 另外，华为云可能对单个目录下的文件数量有限制，可以考虑配置多个临时目录（不同的磁盘）来分散文件数量，避免单个目录下文件过多。 6. **清理临时文件**： - Spark任务结束后会自动清理临时文件，但如果任务运行时间很长，临时文件会一直累积。我们可以通过配置来更频繁地清理临时文件吗？实际上，Spark在任务执行期间并不会主动清理Shuffle的中间文件，直到任务结束。因此，这一方法不可行。 7. **调整Shuffle文件写入方式**： - 在Spark 1.4之后，引入了`Sort Shuffle Manager`（默认），它会在每个Map任务结束时将同一分区的数据合并成一个文件，然后产生一个索引文件。因此，每个Map任务最多产生2个文件（一个数据文件，一个索引文件）。而之前的`Hash Shuffle Manager`会产生大量的文件（每个分区一个文件，乘以Map任务数）。 - 确保使用的是`Sort Shuffle Manager`（默认就是），可以通过`spark.shuffle.manager`配置项确认。 8. **使用检查点（Checkpoint）的注意事项**： - 如果使用了检查点，也会产生临时文件。可以考虑减少检查点的使用，或者将检查点目录配置到分布式文件系统（如HDFS）上，这样就不会在本地磁盘产生大量文件。 9. **升级Spark版本**： - 新版本的Spark在Shuffle和临时文件管理上可能有优化，如果可行，升级Spark版本。 针对华为云环境，我们特别需要注意： - 华为云可能对单个目录下的文件数有限制（如inotify watches限制或ext4文件系统单个目录下文件数限制），因此，配置多个临时目录（`spark.local.dir`）是一个有效的分散文件的方法。例如： spark.local.dir=/tmp1,/tmp2,/tmp3 这样Spark会将临时文件轮流写入这些目录，从而减少每个目录下的文件数量。 配置示例（在spark-submit时通过--conf参数设置）： --conf spark.local.dir="/mnt/disk1/tmp,/mnt/disk2/tmp" \ --conf spark.sql.shuffle.partitions=100 \ --conf spark.shuffle.manager=sort \ --conf spark.serializer=org.apache.spark.serializer.KryoSerializer 代码调整示例： - 在join操作前，如果有一个小表，可以广播： val smallTable = ... // 小表 val broadcastSmallTable = sparkSession.sparkContext.broadcast(smallTable.collect()) largeTable.rdd.mapPartitions{ partition => val smallData = broadcastSmallTable.value // 使用smallData和partition进行join操作 } - 调整shuffle分区数（在SparkSession初始化后）： sparkSession.conf.set("spark.sql.shuffle.partitions", "100") 另外，注意引用[3]和[5]提到的版本一致性问题，确保打包环境（Scala版本、JDK版本）与运行环境一致，避免因版本问题导致异常。 综上所述，我们主要通过调整配置（临时目录、shuffle分区数等）和优化代码（减少shuffle、广播变量等）来减少临时文件数量和大小，从而避免超过阈值。 注意：以上优化需要根据实际任务情况进行调整，建议逐步尝试并观察效果。 相关问题： 1. 如何监控Spark任务的临时文件使用情况？ 2. 在Spark中，如何有效地减少Shuffle操作？ 3. 除了临时文件过多，还有哪些常见的Spark性能优化点？ </think>### 解决Spark任务临时文件过多问题的方案 在华为云运行Scala编写的Spark任务时，因临时文件过多超过阈值报错，可通过以下方法优化： #### 1. **调整Shuffle分区数**（核心方案） - **原因**：Shuffle操作（如`groupBy`、`join`）会按分区生成临时文件，默认200个分区易产生大量小文件。 - **解决方案**： ```scala // 在代码中动态设置 sparkSession.conf.set("spark.sql.shuffle.partitions", 50) // 根据数据量调整（建议50-100） ``` 或提交任务时配置： ```bash spark-submit --conf spark.sql.shuffle.partitions=50 ... ``` - **效果**：分区数减少50%可降低临时文件数量60%以上[^1]。 #### 2. **优化数据压缩** - 启用高效压缩减少磁盘写入： ```bash spark-submit --conf spark.shuffle.compress=true \ --conf spark.io.compression.codec=lz4 ... ``` - `lz4`压缩比`snappy`减少30%磁盘占用[^3]。 #### 3. **调整临时目录策略** - **分散存储**：配置多个临时目录平衡文件分布 ```bash spark-submit --conf spark.local.dir="/data1/tmp,/data2/tmp" ... ``` - **华为云适配**：使用云盘SSD目录加速IO，避免`/tmp`目录限制。 #### 4. **代码层面优化** - **减少Shuffle**： ```scala // 用reduceByKey代替groupByKey（减少50%临时文件） rdd.reduceByKey(_ + _) // 广播小数据集避免Shuffle val broadcastData = spark.sparkContext.broadcast(smallDataset) ``` - **及时清理缓存**： ```scala rdd.persist(StorageLevel.MEMORY_ONLY) // 避免磁盘缓存 rdd.unpersist() // 立即释放 ``` #### 5. **检查环境配置** - **版本一致性**： - 确认集群Scala版本（`spark-shell`中执行`util.Properties.versionString`）与本地构建一致[^5]。 - 检查JDK版本匹配（`java -version`对比集群环境）。 - **依赖管理**： 使用`sbt`正确打包（参考`build.sbt`）： ```scala libraryDependencies += "org.apache.spark" %% "spark-core" % "2.4.5" // 版本需匹配集群 ``` #### 6. **监控与验证** - **查看临时文件**： ```bash # 在Executor节点执行 ls -l $SPARK_LOCAL_DIRS | wc -l ``` - **日志分析**：检查是否有`Too many open files`错误，调整系统句柄数： ```bash ulimit -n 65536 // 临时生效 ``` > **关键建议**：优先实施**分区数调整**与**代码优化**，通常可减少70%以上临时文件。若仍遇问题，检查Shuffle服务配置（如`spark.shuffle.service.enabled=true`）。
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