CIRCOS教程翻译 2.6——spacing

染色体之间的间隔也可以控制,根据上一节文件,来配置主配置文件和spacing文件:

<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>>

<<include ideogram.conf>>
<<include ticks.conf>>

<image>
<<include etc/image.conf>>
</image>

karyotype   = data/karyotype/karyotype.human.txt

chromosomes_units           = 1000000
chromosomes_display_default = no

chromosomes        = hs1:0-200;hs2;hs3;hs4
chromosomes_breaks = -hs1:51-149;-hs2:0-49;-hs2:151-);-hs3:0-99;-hs4:51-149 #这些上一节已经翻译过 
<<include etc/housekeeping.conf>>
<ideogram>

<spacing>

default = 0.005r
break   = 0.5r #添加默认的break大小

<<include break.conf>>

<pairwise hs1 hs2> #也可以用,;等分割两个不同的染色体,只能小于等于2,3以上的测试没成功。。。
spacing = 0.25r
</pairwise>

<pairwise hs3> #表示在3号染色体周围的间距为10M大小
spacing = 10u
</pairwise>

</spacing>

<<include ideogram.position.conf>>
<<include ideogram.label.conf>>
<<include bands.conf>>

</ideogram>



  • 0
    点赞
  • 1
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值