CentOS 7下编译安装Open Babel2.4.1和python绑定

一、Open Babel简介

Open Babel是一款开源自由软件，使用Open Babel可以将一种化学结构类型的文件格式转换成另一种文件格式，非常方便的进行各种类型的化学结构文件进行相互转换。

Open Babel由CC++编写，并提供C ++， Perl， Python等的API接口方便开发。

二、Open Babel 2.4.1的编译安装并绑定Python

 

第一步：下载openbabel 2.4.1安装包

下载地址：https://github.com/openbabel/openbabel/releases点击打开链接

第二步：安装boost库

 

yum install boost
yum install boost-devel 
yum install boost-doc

 

第三步：安装gcc、g++、mke\cmkae

 

yum install gcc
yum install gcc-c++
yum install make
yum install cmake

 

第四步：安装依赖的开发库

 

yum install zlib-devel
yum install libxml2-devel
yum install cairo-devel

Eigen库安装，直接下载Eigen2和Eigen3版版本解压至usr/local/include

 

 

 

http://eigen.tuxfamily.org/index.php?title=Main_Page点击打开链接

第五步：支持Python（Python2.7）绑定，安装python开发库

 

 

yum install python-devel

 

第六步：编译安装

 

tar zxvf openbabel-2.4.1.tar.gz
mkdir build
cd build
cmake ../openbabel-2.4.1 -DPYTHON_BINDINGS=ON      #编译安装Python绑定 
make
make test
make install

 

第七步：配置环境变量

 

gedit ~/.bashrc

#open babel
export PATH=/usr/local/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib
export PYTHONPATH=/usr/local/lib/python2.7/site-packages:$PYTHONPATH   #Python路径添加

source ~/.bashrc

 

最后一步：

检查Open Babel 2.4.1和Python绑定是否安装成功

检查Open Babel 2.4.1

Python绑定是否成功

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