Linux（CentOS 7_x64位）系统下安装DOCK6.8

DOCK6 是UCSF  (加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请，申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。

官网点击打开链接

 

分子对接软件DOCK6.8的安装

 

安装依赖

 

yum install gcc    
yum install gcc-c++   
yum install gcc-gfortran  
yum install make    
yum install cmake 
yum install yum-utils
yum install flex
yum install bison
yum install byacc

串行版安装

 

tar zxvf dock.6.8_source.tar.gz 
cd dock6/install
./configure gnu
make all
make dockclean
cd test
make test
make check

并行版安装

 

tar zxvf dock.6.7_source.tar.gz 
cd dock6/install
./configure gnu.parallel
make all
cd test
make test
make check

（官网讲并行只有超过2个处理器的工作集群才明显，具体安装未仔细测试，此处仅供参考，具体参考官网！）

配置环境变量

 

gedit  ~/.bashrc      #打开.bashrc

#DOCK6.8
export PATH=$PATH:/opt/dock6/bin

source ~/.bashrc      #source立即生效

运行dock6.8

 

dock6.mpi

 

---

DrugAI