DICOM:DICOM三大开源库对比分析之“数据加载”

本文对比分析了dcmtk3.6与dcm4che3.x在解析包含非标准VR DICOM文件时的兼容性问题。dcmtk能够识别并加载非标准VR元素,而dcm4che3则出现错误。问题源于dcm4che3将非标准VR错误标记为UN类型,导致解析长度错误。解决方案包括正确解析和读取非标准VR。
摘要由CSDN通过智能技术生成

背景:

上一篇博文DICOM:DICOM万能编辑工具之Sante DICOM Editor介绍了DICOM万能编辑工具,在日常使用过程中发现,“只要Sante DICOM Editor打不开的数据,基本可以判定此DICOM文件格式错误(准确率达99.9999%^_^)”。在感叹Sante DICOM Editor神器牛掰的同时,想了解一下其底层是如何实现的。通过日常使用以及阅读软件帮助手册推断其底层依赖库很可能是dcmtk,就如同本人使用dcmtk、fo-dicom、dcm4che3等诸多DICOM开源库遇到的兼容性问题类似,——dcmtk兼容性最强,fo-dicom次之,dcm4che3最差

问题:

本篇通过对比dcmtk3.6与dcm4che3.x解析同一特殊dicom文件包含非标准VR的元素)分析dcmtk、dcm4che以及fo-dicom数据加载的兼容性问题。
特殊的dicom文件内容如下:
28 00 20 01 20 20 02 00 30 F8,具体描述如下:

使用dcmtk与fo-dicom加载数据时都未出现错误,例如dcmtk加载数据时的提示如下:

由此可以看出dcmtk已经顺利识别出了非标准VR的元素(0028,0120),并成功加载。
虽然使用fo-dicom加载数据没有出现错误,但是对于上述非标准VR的元素(0028,0120)后的元素未顺利加载,如下图所示:

而dcm4che3加载过程中直接弹出了错误,如下所示:

问题分析:

出现该问题的原因是dcm4che3和fo-dicom在解析0028,0120元素时,对于20 20的非标准VR无法识别。下文中将通过分析dcm4che3与dcmtk的源码来定位问题的具体位置并给出解决方案(此处暂时只对比分析了dcm4che3.3.8最新版与dmctk3.6的源码,对于fo-dicom的源码分析待后续整理完成后再补充)

1. dcmtk3.6源码:

使用dcmtk编写本次数据加载测试工程,简单的示例代码如下:

int main()
{
    OFLog::configure(OFLogger::TRACE_LOG_LEVEL);
    char* ifname = "c:\\1.dcm";
    E_FileReadMode readMode = /*ERM_fileOnly*/ERM_autoDetect;
    E_TransferSyntax xfer =  EXS_Unknown;
    Uint32 maxReadLength = DCM_MaxReadLength;
    bool loadIntoMemory = true;
    DcmFileFormat dfile;
    DcmObject *dset = &dfile;
    if (readMode == ERM_dataset) dset = dfile.getDataset();
    OFCondition cond = dfile.loadFile(ifname, xfer, EGL_noChange, maxReadLength, readMode);
    if (cond.bad())
    {
        return 1;
    }
    return 0;
}

单步调试,可以知道dcmtk加载dicom文件的流程如下:

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