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RSS订阅原创 signal5 本地版安装及使用（Linux系统）
蛋白信号肽的预测网页版有蛋白条数限制，本人实验数据庞大，所以试着利用在Linux系统里安装本地版的signal，其他版本的安装也可借鉴此篇。
2024-07-17 22:55:44
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原创 利用本地版hmmer和blastp进行基因家族的鉴定
复刻文献中提到的在甘蔗中PP2C基因家族鉴定的过程，分3个部分。触类旁通，其他的基因家族可以使用类似方法进行鉴定。
2024-06-04 09:28:54
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原创 双显卡驱动alphafold2炼丹
小小实验室有钱啊，导师丢我两显卡，希望我加快计算进程。（绞尽脑汁，尝试修改alphafold官网提供的源代码，，，，未果，能力有限，无法从源头上实现数据并行【蛋白序列很多，为了加速运行，让显卡各自运行不同的模型，这可以减少整个项目的完成时间】或者是模型并行【相当于蛋白序列很长，一个显卡显存不够用，所以模型跨越在两张显卡上】）走了很多“邪门歪道”，可以实现，我不仅把双显卡分开用（即实现数据并行），还把内存条分开用了（￣□￣｜｜），真是个小机灵鬼。
2024-01-16 11:17:17
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原创 本地版alphafold2批量处理序列
导师把一堆蛋白丢给你，，，，用alphafold2炼丹，不想过劳吧，如何安逸的摸鱼呢，注意查收大礼包。说在前面，本博文仅仅适于已经安装好alphafold2软件、数据库、完成环境配置的友友。
2024-01-15 19:26:38
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原创 alphafold安装及使用（保姆级教程、conda环境）
使用conda安装本地版alphafold-mutimer并使用，预测蛋白互作模型，介绍GPU支持的软件包安装顺序。
2023-09-11 17:50:19
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空空如也
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