- 博客(7)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 快速了解药物设计中的靶标识别与预测
基于网络推理方法是指利用实验数据和计算方法推断药物-靶标二分网格的拓扑和因果关系结构，预测和实验确证疾病的蛋白质或基因网络，发现药物的新靶标或预测全新的药物-靶标相互作用关系。相似性搜索方法依据化学结构或物理化学性质相似的小分子化合物可作用于性质相同或相近的靶标这一理论假设，通过比较目标分子与具有已知靶标的活性分子的化学结构或物理化学性质，去预测目标分子的潜在作用靶标。基于配体的靶标预测，是指将需要预测靶标的化合物与具有已知靶标的化合物的结构特征进行比较分析，从而根据相似性原理预测潜在靶标。
2023-05-18 09:41:28
374
原创 药物研发早期预测细胞毒性的解决方案
在研究中经常会涉及DNA或染色体的损伤，因为DNA损伤与很多疾病的发生有密切的关系，如遗传疾病、肿瘤等。在体外培养，如果将培养的细胞加入圆底的微孔中，这些富集的细胞就会形成离散的球体。这些离散的球体同时包含了暴露在表面的和深埋在内部的细胞，增殖的和非增殖的细胞，外面的富氧层和内部的缺氧中心。基于上述特点，与传统的二维细胞培养方法相比，这种球体可以更好的模拟组织及个体的行为特点。这个完整的实验方案包括了预置模块对延时拍摄的图片进行分析，基于明场的图像识别所有细胞，基于荧光蛋白的表达区分不同的细胞周期。
2023-05-17 09:41:17
312
原创 基于人工智能与机器学习等多种方法的研究内容
（3）小分子在溶液环境中；机器学习技术能利用复杂的算法在大规模、异质性数据集中进行运行,在生物医学方面、人类基因组项目、癌症全基因组项目、等项目上都表现出了巨大的潜力，收集并分析与医学疗法和患者预后相关的大量数据集或能将医学转化称为一种数据驱动、以结果为导向的学科，其对于疾病的检测、诊断都有着非常深远的影响。（4）MOE分子对接（分子指纹图谱、内置的AIDD的方法）。2、反向对接的思想，利用现有小分子来探索对应的靶点：已知化合物的活性，然后研究对哪些靶点是有活性的，X=提取的特征，y是对哪些靶点有活性。
2023-05-16 09:23:11
347
原创 最新突破！天然产物首次实现全合成，轰动整个化学界
机器学习技术能利用复杂的算法在大规模、异质性数据集中进行运行,在生物医学方面、人类基因组项目、癌症全基因组项目、等项目上都表现出了巨大的潜力，收集并分析与医学疗法和患者预后相关的大量数据集或能将医学转化称为一种数据驱动、以结果为导向的学科，其对于疾病的检测、诊断都有着非常深远的影响。研究领域涉及机器学习，芯片数据分析，核酸及蛋白序列分析，DNA，RNA，甲基化测序数据分析，单细胞测序数据分析，miRNA及靶基因分析，癌症相关基因预测及预后分析等，发表SCI论文30余篇，其中一作及并列一作15篇。
2023-05-15 09:43:53
350
1
原创 计算机辅助药物设计助力中药研究
中国科学院上海药物研究所联合创腾科技有限公司开发的中国天然产物数据库(CNPDTM)，系统地收集、整理、分析从我国国产的植物中分离鉴定出的天然产物的物理性质、生物活性及化学结构等信息，结合我国传统中草药的应用实践，利用先进的计算机化学管理手段，为我国的新药、天然产物及相关领域的研究和开发工作提供了好的工具。目前，中药数据库在原有文字描述性数据库的基础上，充分利用了已有的大量实验数据，建立起了数据仓库和挖掘平台，充分应用多库融合共享平台、数据库关联检索、数据挖掘等技术，为形成“数字中药”奠定了初步的基础。
2023-05-12 09:31:14
135
1
原创 【无标题】
深度学习（deep learning）是机器学习的一个分支，是一种以人工神经网络为架构，对数据进行表征学习的算法（简而言之就是深度学习模仿我们人类大脑运行的方式，从经验中进行学习，进而对未来接触的事物做出反应和决策）。那么什么是人工神经网络呢？第二层由神经元组成，它们读入一层的输出，以此类推，更深层的神经元也被称为隐藏层，最后一层是输出层，对输入数据的特征的高度总结输出。和所有的深度学习一样，在基因组中进行深度学习首先也是要确定合适的训练数据集，选择合适的评价指标，这是建立有效的深度学习模型的重要步骤。
2023-05-11 10:07:20
41
1
原创 Nature：药物研发里程碑技术
科研背景生物医学是综合医学、生命科学和生物学的理论和方法而发展起来的前沿交叉学科,基本任务是运用生物学及工程技术手段研究和解决生命科学，特别是医学中的有关问题。机器学习技术能利用复杂的算法在大规模、异质性数据集中进行运行,在生物医学方面、人类基因组项目、癌症全基因组项目、等项目上都表现出了巨大的潜力，收集并分析与医学疗法和患者预后相关的大量数据集或能将医学转化称为一种数据驱动、以结果为导向的学科，其对于疾病的检测、诊断都有着非常深远的影响。CADD（Computer Aided Drug Desig
2023-05-10 09:24:38
384
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人