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RSS订阅原创 通过ncbi的run列表编号利用Aspera来下载fastq文件，通过EBI-ENA数据库
所以我们通过run值来分析 /SRR168/是run的前6位，而/029/是0加上run的后两位，SRR16820629_1是因为该rna为双端测序。所以我们可以通过run值将11位数的run的下载地址拼凑出来。所以结合上述代码的我们就可以构造出一个通过run值来构造Aspera下载地址的脚本了，就不用去ENA一个一个查询了（至于12个字符的run，我目前下载的run值没有碰到过）。当有了run列表后我们不可能一个一个的去ENA搜索他的sra下载地址。在上述逻辑上加入错误处理后可以收集下载不了的run了。
2024-04-14 21:19:37
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空空如也
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