R Markdown 是 R 语言环境中提供的 markdown 编辑工具

下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容。

1）栏目后续章节的文章将深入概括R语言在临床研究和新药创新领域的应用，填补了国内R教材中尚未广泛覆盖的部分内容。

2）专栏每篇文章都在 5000 字以上，质量平均分高达 94 分。已发表章节也会增加新的文章，已发表的文章也会更新版本，可留意专栏内容和题目信息。

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2章8节：一文学会 R Markdown 的文档核心操作，切记文末有R资源的分享_r markdown文件(.rmd)-CSDN博客文章浏览阅读359次。R Markdown 是一种广泛使用的工具，可以帮助数据科学家、统计学家和研究人员创建动态和交互式的报告。它结合了 R 语言的强大数据处理和分析能力，以及 Markdown 的简洁易用的文本格式，使得创建专业和美观的报告变得更加简单和高效。一文让你入门 Markdown ！_r markdown文件(.rmd)https://blog.csdn.net/2301_79425796/article/details/140660144?csdn_share_tail=%7B%22type%22%3A%22blog%22%2C%22rType%22%3A%22article%22%2C%22rId%22%3A%22140660144%22%2C%22source%22%3A%222301_79425796%22%7D

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.......前面部分请点击上面链接看原文（原文6872字）

一、什么是 R Markdown？

R Markdown 是 R 语言环境中提供的 markdown 编辑工具，运用 R Markdown 撰写文章，既可以像一般的 markdown 编辑器一样编辑文本，也可以在 R Markdown 中插入代码块，并将代码运行结果输出在 markdown 里。R Markdown 格式，简称为 Rmd 格式， 相应的源文件扩展名为 .Rmd。输出格式可以是 HTML、docx、pdf、beamer 等。

1、认识 Markdown

Markdown 是由 John Gruber 于 2004 年创建的一种轻量级标记语言，如今已成为世界上最流行的标记语言之一。Markdown 的开发受到了早期电子邮件和 Usenet 帖子中标记纯文本的现有惯例的启发，例如 setext、Textile 和 reStructuredText。Gruber 和 Swartz 的目标是创建一种标记语言，使其在源代码形式下也易于阅读，不像 RTF、HTML 或 wikitext 等较重的标记语言那样包含明显的标签和格式指令。

下表对比了 Markdown 和 Word 在特点和用途上的差异：

	R Markdown	Word
可读书写	高，文档源代码形式易于阅读，不像 HTML 等语言有明显标签和格式指令	中，源代码不可读，需使用专用软件
文件格式	纯文本格式，通常以 .md 或 .Rmd 扩展名保存	专有二进制格式，以 .doc 或 .docx 保存
灵活性	高，能轻松转换为 HTML、PDF、Word 等多种格式	低，转换为其他格式时需使用专门工具
应用范围	广泛，用于博客写作、即时消息、在线论坛、协作软件、文档页面、自述文件等	广泛，用于文档创作、报告、论文等
语法简洁	高，使用 # 表示标题，* 或 _ 表示斜体和粗体等	低，需使用复杂的菜单和工具栏
跨平台	高，支持 macOS、Windows、Linux、iOS 和 Android 操作系统	中，主要支持 macOS 和 Windows
网页友好	高，专为网络写作设计，可轻松创建网站内容	低，需额外工具转换为网页格式
版本控制	高，纯文本格式，非常适合用 Git 等版本控制系统管理	低，二进制格式，不易版本控制
学习曲线	低，简单易用且功能强大	中，功能多样但较为复杂
适合用户	开发者、作家和内容创作者等	商业用户、学术研究者等
创作效率	高，支持自动化生成和复用	中，需手动编辑和格式调整

2、认识 R Markdown

R Markdown是基于Markdown的扩展，旨在使数据分析和报告生成更加便捷。R Markdown不仅保留了Markdown的所有优点，还增加了与R语言无缝集成的功能。通过R Markdown，用户可以在一个文档中编写代码、运行代码并展示结果，使得数据分析流程更加直观和高效。

R Markdown特别适用于以下场景：

• 数据分析报告：将数据分析过程与结果展示集成在一个文档中，便于共享和复现。
• 学术论文：许多学术期刊接受R Markdown格式的投稿。
• 教学材料：通过R Markdown编写教学文档，结合代码示例和解释说明，有助于学生理解。

Markdown与R Markdown的对比

功能	Markdown	R Markdown
文本格式化	是	是
嵌入代码	否	是
动态文档生成	否	是
输出格式	HTML、PDF、Word等	HTML、PDF、Word等
交互性	否	是

在临床数据分析工作中，常常需要把数据置入模型以得出相关结论。一般而言，需完整经历从数据收集、数据清理、数据可视化、建模，直至最后编写报告或制作演示文稿的工作流程。由于RStudio 能够将 R 代码嵌入到 Markdown 格式文件中，从而动态生成研究报告，这种格式被称作 R Markdown 格式，简称为 Rmd 格式，相应的源文件扩展名是“.Rmd”。该报告能够编译并输出为其他多种格式，如 HTML、docx、pdf、beamer 等数十种格式。

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