今天给同学们分享一篇生信文章“Exploring the causality and pathogenesis of systemic lupus erythematosus in breast cancer based on Mendelian randomization and transcriptome data analyses”,这篇文章发表在Front Immunol期刊上,影响因子为7.3。
结果解读:
SNP的选择
总体而言,这项MR研究分析了共计243,218名欧洲血统个体(128,178例患者和115,040例对照组)以及107,936名东亚血统人群(9,774例患者和98,162例对照组)。作者从GWAS中提取了与SLE显著相关的IVs(p < 5 × 10 −8 ),并去除了LD(r 2 <0.001,10,000-kb)。此外,作者分析中的F统计量大于100,表明这些IVs能够强有力地预测SLE的发生率。
遗传易感性与SLE和乳腺癌风险
MR分析显示欧洲队列中SLE与乳腺癌之间不存在因果关联(乳腺癌:OR 0.9985,95%CI 0.9873-1.0099,p=0.79;ER+乳腺癌:OR 0.