PCI 标准的开发于1990年前后开始于英特尔公司。1992年6月22日,英特尔发表 PCI 1.0 标准,该标准仅限于组件级规范。1993年4月30日,PCI-SIG 发表了 PCI 2.0 标准,这个标准第一次建立了连接器与主板插槽间的标准。
PCI 标准被立即应用于服务器中,取代了先前的MCA及EISA,成为服务器扩展总线的不二选择。在主流个人计算机中,PCI 标准则缓慢地取代着 VESA 局部总线(VLB);直至1994年后期第二代奔腾 PC 推出后,该标准方得以实现具有重要意义的市场突破。1996年,VLB 彻底退出了个人计算机市场,制造厂商甚至将 PCI 标准应用于486计算机中。EISA 标准则与 PCI 标准共存使用至2000年。苹果电脑在1995年中期将 PCI 标准应用于专业产品 Power Macintosh 电脑中(而取代了 NuBus ),而消费者产品 Macintosh Performa 则于1996年中期完成了换代(取代了 LC PDS)。
后续版本的PCI标准不断加入了新的功能与性能提升,包括 66MHz/3.3V 标准,133MHz PCI-X以及适应多种主板板型等。2004年,串行总线标准PCI Express面世后,主板制造商逐渐减少了传统PCI插槽,而引入PCI Express(PCIe)接口。虽然这两种接口还会同时并存,但是传统的PCI总线将会慢慢的消失。