wrf-hydro环境部署,运行测试

一、检查所需编译器是否完备

本项目需要在编译器gcc,g++,gfortran下进行,可以使用which命令进行查找，若未安装，可运行以下代码：

sudo apt-get install gcc

sudo apt-get install g++

sudo apt-get install gfortran

检查编译器

二、安装wrf-hydro

（应该后面安装，我操作的时候上来就把这个装了）

三、安装依赖库

此处安装可以选择windows下安装再finalshell传输，后面两个我选择直接在虚拟机中打开网页再直接extract解压，感觉更省事。

1.mpich依赖库安装 下载链接：https://www.mpich.org/downloads/

（也可以wget命令下载）这里我选择的版本是4.2.2

利用finalshell传输压缩文件

解压缩进入对应文件目录

检查环境

make编译

make install安装

利用vim添加环境变量

source 更新环境变量

tar zxvf mpich-4.2.2.tar.gz
cd ./mpich-4.2.2
./configure --prefix=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/mpich
make
make install
vim ~/.bash_profile 
export PATH=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/mpich/bin:$PATH
source ~/.bash_profile

2.zlib安装     下载链接：https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/OnLineTutorial/compile_tutorial/tar_files/zlib-1.2.7.tar.gz

检查环境，安装编译的基本步骤是相似的。

tar zxvf zlib-1.2.7.tar.gz
cd ./zlib-1.2.7
./configure --prefix=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/zlib
make
make install

3.hdf5安装

下载链接：https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.12/

 编译安装并更新环境变量。

tar zxvf hdf5-1.12.2.tar.gz
cd ./hdf5-1.12.2
./configure --prefix=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/hdf5 --with-zlib=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/zlib --enable-fortran --enable-cxx
make
make install
vim ~/.bash_profile
export PATH=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/hdf5/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/hdf5/lib:$LD_LIBRARY_PATH

4.netcdf-c依赖库安装

下载链接：https://downloads.unidata.ucar.edu/netcdf/

  

这里我就直接虚拟机内下载了，设置一组临时变量，检查环境，make编译，make install安装

tar zxvf netcdf-c-4.9.2.tar.gz
cd ./netcdf-c-4.9.2
export LD_LIBRARY_PATH=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/zlib/lib:/home/downloads/wrf-hydro/libraries/hdf5/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export CPPFLAGS="-I/home/downloads/wrf-hydro/libraries/zlib/include -I/home/downloads/wrf-hydro/libraries/hdf5/include"
export LDFLAGS="-L/home/downloads/wrf-hydro/libraries/zlib/lib -L/home/downloads/wrf-hydro/libraries/hdf5/lib"
./configure --prefix=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf --disable-dap --enable-netcdf-4 --enable-netcdf4 --enable-shared
make
make install

 5.netcdf-fortran安装

下载链接：https://github.com/Unidata/netcdf-fortran/releases/tag/v4.4.4

tar zxvf netcdf-fortran-4.4.4.tar.gz
cd ./netcdf-fortran-4.4.4
export LD_LIBRARY_PATH=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf/lib:/home/downloads/wrf-hydro/libraries/zlib/lib:/home/downloads/wrf-hydro/libraries/hdf5/lib$LD_LIBRARY_PATH
CPPFLAGS="-I/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf/include" LDFLAGS="-L/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf/lib" 
./configure --prefix=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf
make
make install

利用vim添加环境变量,再source 更新环境变量

vim ~/.bash_profile
export NETCDF=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf
export PATH=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/downloads/wrf-hydro/libraries/netcdf/lib:$LD_LIBRARY_PATH
source ~/.bash_profile

这里就是怪啊，我一开始编译那步卡了一个中午，也不是卡，就是编译了一中午，也确实一直在编译，一会儿蹦一行，后来我果断重新弄了。查了一下有个博主说：

如果在netcdf-fortran编译过程中出现了type mismatch的问题

就把netcdf都升级到最新版本，再次编译，可以解决；或者将编译器版本，原gcc,gfortran-11版本太高，降为-9版本，也可解决问题。

这里附个链接：http://t.csdnimg.cn/6yL5S可以参考

三、编译wrf-hydro

在 Linux 环境中，配置环境变量时通常会创建一个新的变量文件（例如 .bashrc, .bash_profile, .profile, .zshrc 等），而不是直接修改系统文件或原始文件，是出于安全稳定的考虑，并且可以根据用户需要进行特定的配置。

复制环境变量文件 cp template/setEnvar.sh ./

编辑环境变量文件vim setEnvar.sh

加入 export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1

tar zxfv wrf_hydro_nwm_public-5.2.0.tar.gz 
cd wrf_hydro_nwm_public-5.2.0/trunk/NDHMS
cp template/setEnvar.sh ./
vim setEnvar.sh

 更新检查后进行编译：

source setEnvar.sh
./configure 
./compile_offline_NoahMP.sh setEnvar.sh

编译成功如下

四、下载数据并测试

下载链接：https://github.com/NCAR/wrf_hydro_nwm_public/releases/download/v5.2.0/croton_NY_training_example_v5.2.tar.gz

mkdir example_case && cd example_case
mkdir NWM
mkdir FORCING
mkdir Gridded_no_lakes
mkdir Reach
mkdir supplemental
mkdir Gridded && cd Gridded
mkdir DOMAIN
mkdir RESTART

复制到相应目录： 

cp -r example_case/FORCING/ /home/downloads/wrf-hydro/example_case/Gridded
cp -r example_case/NWM/DOMAIN /home/downloads/wrf-hydro/example_case/Gridded
cp -r example_case/NWM/RESTART /home/downloads/wrf-hydro/example_case/Gridded
cp -r example_case/NWM/nudgingTimeSliceObs/ /home/downloads/wrf-hydro/example_case/Gridded
cp -r example_case/NWM/namelist.hrldas /home/downloads/wrf-hydro/example_case/Gridded
cp -r example_case/NWM/hydro.namelist /home/downloads/wrf-hydro/example_case/Gridded

运行并查看成功与否

cd ~/wrf/example_case/Gridded
mpirun -np 2 ./wrf_hydro.exe


tail -1 diag_hydro.00000