- 博客(4)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 r入门，数据类型
(其中的dimnames=list（）函数用于给行列加行名列名，byrow = TRUE表明矩阵按行填充，，false是按列填充即byrow=false注意true和false要大写）这里我们用之前创造的y数据矩阵，用y[，]可以选取第几行第几列的数值，例如y[2,3]选取的是第二行第三列，应该是12。在数据框中数据选取也可以类似于之前的[1,2]是选取第一行第二个数据，[1:2]是选取一二列。在数组中数据的选取类似于矩阵，例如z[1,2,2]代表选取第二个数据集的第一行第二列数据。
2024-10-09 09:25:26
343
原创 dnbc4tools下载安装
使用 Conda 安装 htslib 和 samtools（版本均为 1.18），并从 bioconda 和 conda-forge 通道安装。软件安装：通过 Conda 和 pip 安装特定的生物信息学工具，如 dnbc4tools，htslib 和 samtools。Conda 环境：用于创建一个隔离的环境，其中包含特定版本的软件和依赖，确保软件的兼容性和可重复性。这些步骤和工具的选择表明，这是一个为生物信息学分析设置的工作环境，旨在确保软件的兼容性和可移植性。安装依赖包，在官网上可以查到。
2024-09-26 20:04:49
726
原创 火山图代码
scale_color_manual(values = c(not_significant="grey", up = "red", down = "green"))+ # 定义颜色。labs(x = "Log2 Fold Change", y = "neg_log10_pvalue", title = "Volcano Plot") + # 添加坐标轴标签和标题。# data
2024-09-24 09:26:41
333
原创 9.4培训2
随后对于测序中关于UMI的一些问题进行处理例如去除全是重复序列的UMI、去除bp小于10的UMI、对于不同基因序列但拥有同样的UMI进行校正。首先获取测序数据，文件是fastq的格式，而且存在fastq1、fastq2两个文件，他们分别是从3’和5’两个方向测序，可以起到一个提高测序准确度的作用。然后通过PISA将其转化为fastq＋的文件，同样的对于Oligo的fastq文件也需要将其进行拆分后转变为fastq＋文件。而UMI则是对基因的数量进行测行，起到一个定量的作用。（UMI可以用来去除PCR重复）
2024-09-04 16:24:17
396
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人