如何利用graphpad prism 进行亲和力曲线拟合（Kd-model）

数据来源：小分子与蛋白微量热泳动测定

X值：药物浓度（Does）

Y值：不同浓度对应的荧光值（Fnorm/Response）

操作步骤：打开prism，选择xy （Does/Response模式）

根据实际情况选择n值

定义error bar为SD或者SEM（SEM看起来误差棒会更小）

输入X和对应的Y1，Y2，Y3

点击analysis，选择非线性拟合（nonlinear curve），可套用的方程比较多，建议根据实际情况选或者多试几个。

我的数据是测量小分子与蛋白的亲和力，蛋白上仅有一个小分子结合位点，所以我是用的是Binding saturation里的One site-specific binding，Total是用亲和力，Specific则忽略了非特异性结合，我认为可以根据R值选择R值更高的数据，这样应该更准确。