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RSS订阅原创 【4】RagTag-基于近缘/同物种的基因组同源组装
RagTag简介RagTag可以进行错误组装校正、scaffold组装和修补、scaffold合并等，一共分四步：correct，scaffold，patch，merge。之后，可以用Liftoff进行基因注释。RagTag的conda安装conda install -c bioconda ragtag1. correct校正是使用参考基因组来鉴定和校正contigs中的组装错误，该步骤不会将序列减少或增加，仅仅是将序列在错误组装的位置进行打断。ragtag.py corr.
2021-12-16 15:59:46
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原创 【2】基因功能注释之SwissProt和Interproscan
基因组注释之利用SwissProt 和 Interproscan对基因进行功能注释
2021-12-16 13:27:34
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原创 【1】RNA-seq 测序数据之Hisat2比对-featurecount计算-EdgeR分析
使用Hisat2-featurecount-EdgeR对RNA-seq 测序数据进行快速计算及结果呈现
2021-12-08 12:47:42
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空空如也
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