R Shiny网页在服务器的部署

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前言

以此文章记录我花了一整天的R Shiny部署过程。也为大家在未来的学习和部署提供参考。
我的服务器环境：阿里云CentOS 7.9

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一、新建用户

shiny-server默认是以shiny用户来运行shiny应用的。在安装shiny-server的过程中，通常会创建一个名为shiny的用户。这是因为shiny-server的默认配置文件中，运行用户被设置为shiny，如果你在安装shiny-server时没有创建shiny用户，而是使用了其他的用户，那么你需要修改shiny-server的配置文件，将运行用户改为你创建的用户。否则，shiny-server可能无法正常运行。

1、在root账号下注册新账号，账号名为shiny。

useradd shiny

为账号设置密码

passwd shiny

2、接下来给用户添加root权限，这样就可以在用户账号下使用sudo命令了。通过修改sudoers文件来赋予新用户root权限。首先，查找sudoers文件的位置：

whereis sudoers

为其赋予写权限：

chmod -v u+w /etc/sudoers

使用vim打开并修改sudoers文件。

sudo vim /etc/sudoers

在文件中添加新用户信息，找到 root ALL=(ALL) ALL 该行，在下面添加 shiny ALL=(ALL) ALL，如果不想每次sudo都要输入密码，可以写这个 shiny ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL，然后:wq保存并退出。

3、收回sudoers文件的写权限，防止他人篡改：

chmod -v u-w /etc/sudoers

二、安装R环境

1.安装R

首先进入用户账号

su - shiny

然后可以跟随官网步骤：https://posit.co/download/shiny-server/
Step1 - Select your server version ：我的是CentOS 7+
Step 2 - Install EPEL ：

sudo yum install epel-release -y

Step 3 - Install R and the Shiny R package : 如果用官网的代码

sudo yum install R

安装的不是最新版，我这里默认从EPEL安装的是R 3.6.0版本

如果满足不了项目需求，可以手动安装最新版。

2.如何安装最新版R

首先，需要安装一些必要的依赖项。可以使用以下命令安装它们：

sudo yum install -y gcc gcc-c++ gcc-gfortran readline-devel cairo-devel libpng-devel libjpeg-turbo-devel libtiff-devel pango-devel libicu-devel libxml2-devel libcurl-devel openssl-devel libXt-devel

接下来，需要下载R语言4.3.2包。可以使用以下命令从官方网站下载它：

wget https://cran.rstudio.com/src/base/R-4/R-4.3.2.tar.gz

下载完成后，需要解压缩该文件并进入解压缩后的目录：

tar -xzf R-4.3.2.tar.gz
cd R-4.3.2

现在，可以运行以下命令来配置和编译R语言：

./configure --prefix=/usr/local --enable-R-shlib
make
sudo make install

首先执行第一句：

报了个错，还需要安装bzip2，运行如下代码：

sudo yum install bzip2-devel

再次运行以下命令：

./configure --prefix=/usr/local --enable-R-shlib

又报错了，这里我们遵照提示，不用PCRE2了，改用PCRE1，运行：

./configure --prefix=/usr/local --enable-R-shlib --with-pcre1

这下第一句执行成功了，再执行第二句：

make

成功！再执行第三句：

sudo make install

编译完成后，可以使用以下命令启动R语言检查是否已安装最新版：

R

3.安装shiny包

继续遵照官网剩下的Step2安装shiny包：

sudo R -e "install.packages('shiny', repos = 'https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/')" #主动添加源，修改默认国外源

tips:如果sudo R报找不到命令的错误，可以手动输入R进入R语言，然后用install.packages(‘shiny’, repos = ‘https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/’)安装，我就是这样，如下图：

两次都是yes，因为运行不了sudo R所以权限不够，只能将包安装在用户目录下。

四、安装Shiny Server

遵照官网Step4 - Install Shiny Server ：
首先进入/srv文件夹，一会把shiny-server-1.5.21.1012-x86_64.rpm文件下载到这，下载到其他地方也行。

cd /srv

运行：

sudo wget https://download3.rstudio.org/centos7/x86_64/shiny-server-1.5.21.1012-x86_64.rpm

安装server：

sudo yum install --nogpgcheck shiny-server-1.5.21.1012-x86_64.rpm

安装完成后可以执行以下代码查看server运行的状态：

sudo systemctl status shiny-server

绿色显示正在运行。在此也给出其他关于Shiny Server的指令：

##重启
sudo systemctl restart shiny-server
##查看状态 
sudo systemctl status shiny-server 
##开启 
sudo systemctl start shiny-server 
##停止 
sudo systemctl stop shiny-server

此时，在浏览器输入 <服务器ip>:3838 就可以访问shiny-server的默认主页（3838是shiny-server的默认端口号），比如我的服务器ip是112.124.7.213，那就输入112.124.7.213:3838。

注意公网ip需要开放服务器端口3838，即可正常访问，我用的是阿里云服务器，在服务器控制台 - 网络与安全 - 安全组

选择“操作栏”的“管理规则”，手动添加一栏

五、展示自己的网页

将自己的Rshiny项目复制进 /srv/shiny-server

图中shiny-app是我自己的项目，其余两个是官方示例。
我的shiny_app文件夹内容如下：

此时，通过 <服务器ip>:3838/<文件夹名> 即可访问，比如对于我就是112.124.7.213:3838/shiny_app

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总结

还有不足理解不深的地方，请大家多指教。