Python argument types in rdkit.Chem.rdmolfiles.MolToSmiles(NoneType) did not match C++ signature

         在调用rdkit库的Chem.MolToSmiles()时报这样的错误：

        首先安装的库是没有问题的，所以考虑读取的文件格式有问题，对其进行定位：

from rdkit import Chem

f = '../../data/fastei/HMDB/structures.sdf' 
suppl = Chem.SDMolSupplier(f)
for j in tqdm(range(len(suppl))):
    try:
        smi = Chem.MolToSmiles(suppl[j])
    except:
        print('Error:', j)

        然后我们打印一下idx为1380的mol，发现它是None：

        所以我们需要过滤掉格式错误的mol，可以用这样一个列表推导式：

mols = [mol for mol in suppl if mol] # 如果是mol的话那么保留它
print(len(mols)) # 217766，论文中说是217759

        这样就过滤掉了格式不正确的mol：

        然后就可以调用MolToSmiles()了：

print(Chem.MolToSmiles(mols[0])) 

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