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RSS订阅原创 V3D/Vaa3D中插件的编译方法
一般我们可以编写相关代码，并通过VS的x64命令行进行编译，得到V3D的插件。一般的流程：编写好工程，得到pro文件、cpp文件、h文件等。打开VS的x64命令行，输入qmake，回车。将得到一个空的debug文件夹，一个空的release文件夹，以及Makefile，Makefile.Debug，Makefile.Release三个文件。（注意请提前关闭V3D软件，使其不要运行。） 第一次编译某个插件的工程时，输入nmake -f Makefile.Release，回车。将在release文件夹
2021-01-18 15:18:53
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原创 使用MathType的一些技巧
在word中经常需要使用MathType编辑公式。在最终稿出来之前，修改格式的频率可能会比较高，一个个手动调整非常繁琐，费时费力，还容易有遗漏和错误。我们可以利用MathType自带的一些功能去批量处理一些操作。一下是我小结的一些问题和解决办法：需要有公式编号找到菜单栏中的MathType—>“右编号”。需要批量调整格式。打开一个公式，自己先调整到想用的格式。然后点击“预置”—>“公式预置”—>"保存到文件”—>命名一个你这个格式的名字。然后找到菜单栏中的MathType—
2020-07-23 11:13:19
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原创 Adobe reader 闪退处理办法
安装官方的adobe reader XI打开pdf文件，打开大约十几秒就自动退出了。解决办法：断你网！具体步骤：开始->控制面板-系统和安全->Windows防火墙->高级设置->出站规则->新建规则->程序->下一步->此程序路径->下一步->阻止连接->下一步->自定义一个名称->完成。其中打开高级设置那步可能出现**“打开高级安全windows防火墙管理单元提示0×6D9”**。防火墙出错代码0×6D9解决方法：
2020-07-16 09:45:36
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原创 matlab的textread()函数用法
参考来源：http://blog.sina.com.cn/s/blog_9e67285801010bju.htmltextread基本语法是：[A,B,C,…] = textread（filename,format）[A,B,C,…] = textread（filename,format,N）其中filename就是文件名， format就是要读取的格式，A,B,C就是从文件中读取到的数据。必须严格遵守用法不可出现data=textread(filename,format,N)的形式其中括
2020-05-29 20:20:51
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原创 相关性分析和相似度计算
要计算两个对象的相似性，有很多种方法可以做相关性分析。简单的举例几个机器学习中常用的样本相似性度量方法：欧式距离（Euclidean Distance）汉明距离（Hamming Distance）曼哈顿距离（Manhattan Distance）余弦相似度（Cosine）修正余弦相似度（Adjusted Cosine）皮尔逊相关系数（Pearson）斯皮尔曼相关系数（Spearman）1、 欧式距离（Euclidean Distance）欧式距离全称是欧几里距离，是最易于理解的一种距离
2020-05-29 13:58:04
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原创 precesion，recall，F1
precesion：精确率/查准率，即在检索后返回的结果中，真正正确的个数占整个结果的比例。recall：召回率/查全率，即在检索结果中真正正确的个数 占整个数据集（检索到的和未检索到的）中真正正确个数的比例。FN：False Negative,被判定为负样本，但事实上是正样本。FP：False Positive,被判定为正样本，但事实上是负样本。TN：True Negative,被判定为负样本，事实上也是负样本。TP：True Positive,被判定为正样本，事实上也是证样本。这里的正样本和
2020-05-25 21:35:20
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原创 Excel的一些小用法
1.求A1:D20区域内非零的最小值,用下面的数组公百式;=MIN(IF(A1:D20>0,A1:D20))公式以Ctrl+Shift+Enter结束。找第二小的值，公式稍复度杂：=LARGE(IF(A1:D20>0,A1:D20),COUNTIF(A1:D20,">0")-1)公式以Ctrl+Shift+Enter结束。找第三小的将公式最后的1改为问2即可，以此类推。注意：非零值中有相等的数据时，会答出现排位不同而查找结果相同的现象。比如有两个单元格的值均是最专小值属1，
2020-05-09 17:21:24
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原创 如何寄送国际快递
有时候，我们需要向国外寄送快递，可以通过一些国际快递公司来完成。比如DHL中外运-敦豪国际航 空快件有限公司，官网是www.5idhl.com。该公司在全国各地设有服务点，可以通过官方微信号：DHL快递，查询其相关的业务。最近新冠病毒疫情蔓延全球，DHL有一个爱心防疫包的功能，如果直接寄送一些防疫物品，称重计费价格不菲。而通过爱心防疫包，价格是一口价的，较为便宜。（重量2kg以内，日本/澳...
2020-04-04 19:44:26
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原创 QT中常用函数
QFileInfo的几个构造函数：QFileInfo ( )QFileInfo ( const QString & file )QFileInfo ( const QFile & file )QFileInfo ( const QDir & dir, const QString & file )QFileInfo ( const QFileInfo &am...
2019-12-07 09:57:02
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原创 java正则表达式小结
\d 的含义是 [0-9]\w 任何一个字母数字字符（大小写均可）或下划线，等价于 [A-Za-z0-9_]+表示匹配一个或多个字符（至少一个，不匹配零个字符的情况）*表示含有零个或者多个指定的字符? 表示匹配零个或者一个字符import java.util.regex.Matcher;import java.util.regex.Pattern;/* \d 的含义是 [0-9]...
2019-11-20 19:32:41
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原创 Neuron DataBase
gold166 benchtesting neuron reconstructions (7978 reconstructions)：https://github.com/BigNeuron/Data/releasesfirst2000：https://alleninstitute.org/bigneuron/data/#dataprotocol
2019-11-13 14:56:58
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原创 ofstream打开失败解决方法及V3D快速启动
ofstream有时会打开失败，即ofs.fail()==true。并且在有的文件路径能够打开，成功生成文件，有的路径却不能。其原因可能是没有系统写文件的权限。例如，在使用V3D中某个插件的dofunc功能的时候，由VS打开的命令行默认路径是c:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 10.0\VC，在这个路径是没有权限生成文件的。但是用同一个插...
2019-11-07 16:10:12
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原创 v3d编译APP2插件时报错——解决方法：
v3d编译APP2插件时报错：找不到boost\config.h解决方法:安装V3D时安装过一个boost的库。将其中的Path\local\boost_1_61_0\boost文件夹复制到Path\v3d_external\v3d_main\common_lib\include里。如图：⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇⬇...
2019-11-07 15:20:02
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原创 V3D中常用的插件的dofunc命令小结
V3D中有一些常用的插件，其自带了dofunc功能，方便批量处理或者debug。以下小结一下常用的dofunc命令格式APP2V3DPath /x pluginName /f funcName /i fname /p inmarker_file channel threshold b_256cube /o output_file_name例如：E:\V3D\v3d_external...
2019-11-05 21:11:20
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原创 V3D中神经元SWC颜色对照图及色彩搭配
Vaa3d中神经元重建结果颜色由SWC文件中的type列控制数字颜色0白色1黑色2红色3蓝色4紫红色5天蓝色6黄色7青绿色20-275用于matlab热力图下图Vaa3d重建颜色渲染对照图，最左边的白色为type值为0。Vaa3d重建结果颜色渲染对照表在v3d_external\v3d_main\3...
2019-11-05 14:24:58
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原创 C++创建新的文件夹
C++在某个路径下创建新的文件夹，用以保存结果。首先判断此文件夹存不存在。如果不存在就创建，存在就输出。QString save_path = canonicalPath+"//"+basename;QDir dir(save_path);if (!dir.exists()){ dir.mkpath(save_path);}else{cout<<"Save_path alre...
2019-11-01 09:53:10
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原创 C++常用类型转换
1.QString转stringQString qstr = "test";string s = qstr.toStdString();2.string转QStringstring s = "test";QString qstr = QString::fromStdString(s);3.QString转char *方法1：QString qstr = "test"; c...
2019-11-01 09:48:43
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原创 V3D中关于dofunc的使用
利用控制台可以直接调用插件。直接调用插件的好处是免去了打开程序的等待时间、打开图片的时间、拖入swc和marker等的时间，可以加速调试。不方便的是插件的数值输入可能不太方便。采用控制台直接运行方式，调用的是dofunc，从图形界面上运行的是domenu。调用格式如下vaa3d -x plugin_name -f funcname -i <inimg_file> -o <...
2019-10-30 16:34:03
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原创 V3D/Vaa3D installation procedures in Windows(VS2013) V3D安装教程
官方安装教程网址：https://github.com/Vaa3D/Vaa3D_Wiki/wiki/Build-Vaa3D-on-Windows-with-qmake-using-VS2013-and-Qt4.8.6安装方法主要和Windows系统下VS2010版的差不多，新增了一些步骤。在此仅介绍一下新的的步骤可能遇到的问题和解决方法。在Windows系统下VS2010版V3D安装方法参考我...
2019-10-30 10:54:16
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原创 v3d编译bigneuron_miroslav_r_Advantra插件时报错——解决方法：
前提：软件使用的是VS2013的版本及V3D。v3d编译bigneuron_miroslav_r_Advantra插件时报错：error C2556: ‘int round(float)’ : overloaded function differs only by return type from ‘float round(float) throw()’解决方法:将toolbox.cp...
2019-10-29 10:35:02
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原创 C++函数默认参数小结
函数的默认参数值，即在定义参数的时候同时给它一个初始值。在调用函数的时候，我们可以省略含有默认值的参数。也就是说，如果用户指定了参数值，则使用用户指定的值，否则使用默认参数的值。void Func(int i = 1, float f = 2.0f, double d = 3.0){ cout << i << ", " << f <<...
2019-09-19 11:22:36
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原创 Vaa3D中V3D_FLOAT32类型的图像数据的使用
V3D中使用的常见图像数据的每个像素强度一般是整数，有V3D_UINT8（datatype==1）V3D_UINT16（datatype==2）这两种。但有时图像处理后，可能会使用到一些带小数的“图”，即长宽高大小和原图像一样的一个数据表，类型为V3D_FLOAT32（datatype==4），例如做完距离变换后生成的距离图。下面介绍一些V3D_FLOAT32的数据使用方法：1.从某...
2019-09-03 10:46:55
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原创 Vaa3D (V3D) installation procedures in Windows(VS2010) V3D安装教程
官方安装教程网址：https://github.com/Vaa3D/Vaa3D_Wiki/wiki/Build-Vaa3D-on-Windows-%28VS2010-and-QMake%29安装方法主要按以上网址的步骤进行。但是途中依然会碰到很多问题。以下对我遇到的一些问题进行小结。重要提示：V3D开发版对VS的环境干净程度要求挺高，最好不要同时有VS2010以上的版本，不然很容易有各种冲突。...
2019-08-19 15:25:27
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原创 Vaa3D (V3D) installation procedures in Ubuntu
官方安装教程网址：https://github.com/Vaa3D/Vaa3D_Wiki/wiki/Build-Vaa3D-on-Linux实际安装过程中可能有很多问题需要解决。除了下载v3d_external和vaa3d_tools这两个文件夹以及下载Qt这些步骤外，建议主要按本文档的步骤顺序安装Linux版本的V3D，官方安装步骤为辅。以下是我总结的一些问题的解决方法和安装步骤。Qt下载地...
2019-04-29 14:33:03
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