Ubuntu+Anaconda+JupyterLab+Bokeh 远程配置交互式Web可视化开发环境

最新推荐文章于 2024-07-06 23:21:33 发布

Javy Wang

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分类专栏： Python # 可视化 # Ubuntu 文章标签： Ubuntu anaconda jupyterlab bokeh web可视化

本文链接：https://blog.csdn.net/DSTJWJW/article/details/107104447

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0. 环境说明

服务器 华为 RH2288 V3
硬件配置 Intel® Xeon® CPU E5-2650 v4 @ 2.20GHz 64位
操作系统 Ubuntu 18.04.2 LTS
软件版本

anaconda3 Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh
conda 4.8.2
python 3.8.3
jupyterlab 2.1.5
bokeh 2.1.1

1. 安装配置

以下安装过程均是在远程连接Ubuntu服务器的情况下使用命令行安装的。

远程连接Ubuntu服务器命令为

ssh username@192.168.0.0

IP地址填自己服务器地址就行。

如果是直接登录Ubuntu系统或者是在Mac笔记本上安装，本教程也是适用的。

如果是windows系统，可以在官网上下载anaconda安装包，直接像安装其他客服端一样在图形界面安装就行，记得勾选添加路径到环境变量中，这样就不用自己配置环境变量。具体可以参考文章Windows10下安装Anaconda3(64位)详细过程，jupyterlab以及bokeh依然可以采用本教程进行安装。

如果已经安装好了anaconda3可以跳过步骤1.1，直接看后面。
如果不需要用JupyterLab可以跳过步骤1.2，直接进入1.3。

1.1 Anaconda 安装

Anaconda是一个开源的Python发行版本，其包含了conda、Python等180多个科学包及其依赖项。因为包含了大量的科学包，Anaconda 的下载文件比较大（约 500 MB左右）。

注意安装之前先查看一下服务器或者电脑的硬件配置，然后选择适合的版本以及安装路径。

下载

去官网 https://www.anaconda.com/distribution/#download-section 找到合适版本对应的下载网址，如
https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh ，有522MB。

然后输入以下命令下载anaconda

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh

下载过程界面如下
在这里插入图片描述

下载完毕后可以在当前目录下看到anaconda的安装包
在这里插入图片描述

安装

输入以下命令开始安装

bash Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh

安装过程界面如下，开始要一直按enter确认各种协议
在这里插入图片描述

一直确认直到出现提醒是否接受这些协议，确认接受之后就可以看到默认安装目录了，这里默认是在账号主目录下创建了anaconda3这个文件夹。

如果需要更换的话在 [/home/wjw/anaconda3]>>> 后面输入指定目录就行。

在这里插入图片描述

接受默认路径的话，直接enter继续进行，后面就是安装各种包。这些包安装结束后会提示是否初始化anaconda3。
在这里插入图片描述

配置

安装完成后，查看一下conda和python的版本以及默认路径，发现不是在 /home/wjw/anaconda3 下面。原因是之前已经用root账户在服务器上安装过了anaconda3和python3，都在系统中 /usr/local/anaconda 路径下，并且用户环境变量也配置成了系统中的路径。

在这里插入图片描述

此时可以看下用户环境中的配置文件，输入以下命令

vim ～/.bashrc

进入～/.bashrc 文件
在这里插入图片描述

可以看到配置文件最后面已经将anaconda3的路径改为了 /home/wjw/anaconda3，那么只需要让其生效即可。

source ～/.bashrc

可以看到conda的默认路径已经将 /home/wjw/anaconda3/bin/conda 放在了最前面，这就意味着刚刚安装的anaconda已经生效了。
在这里插入图片描述

这一部分参考了以下文章
Ubuntu下安装Anaconda（命令行）教程
 Ubuntu18.04 安装 Anaconda3

1.2 JupyterLab 安装

JupyterLab是Jupyter主打的最新数据科学生产工具，某种意义上，它的出现是为了取代Jupyter Notebook。不过不用担心Jupyter Notebook会消失，JupyterLab包含了Jupyter Notebook所有功能。特别是，最近Jupyter还推出了Debug工具，支持断点调试等功能，效果不输PyCharm。

创建虚拟环境并安装

一般会创建一个新的conda虚拟环境用于开发某一工程项目，这样可以避免不同的python库之间产生冲突，因为有些项目可能需要不同版本的python库。

这里，创建一个名为 jupyterlab-debugger 的虚拟环境，同时安装notebook、jupyterlab等工具，以及支持Debug功能的xeus-python、ptvsd、nodejs等包。

conda create -n jupyterlab-debugger -c conda-forge xeus-python=0.8.0 notebook=6 jupyterlab=2 ptvsd nodejs

安装过程如下
在这里插入图片描述

中间会提醒一些包会被安装，确认即可。（可以看到python-3.8.3被安装了）
在这里插入图片描述

安装完成后会提醒如何激活新创建的这一虚拟环境。
在这里插入图片描述

激活虚拟环境

激活新创建的虚拟环境 jupyterlab-debugger
在这里插入图片描述
可以看到python版本已经变为了3.8.3，说明已经进入了虚拟环境。

打开JupyterLab

如果是直接登录Ubuntu系统或者是在Mac笔记上安装的话，直接输入 jupyter lab 命令即可在浏览器中打开JupyterLab交互式编程环境。（如果是Mac笔记本远程连接服务器，如本文，那么在Mac上安装了XQuartz的话，也可以在本地看到JupyterLab交互式界面。）
在这里插入图片描述

JupyterLab交互式界面如下图所示
在这里插入图片描述
还有另一种更加方便的远程打开 Jupyterlab 的方法，即在服务器上启动 Jupyterlab，然后通过访问服务器IP和相应端口在本地打开Jupyterlab界面，这样速度基本上等同于在服务器上编程，比上面的XQuartz方法好太多。具体教程参考这篇博文。