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本篇关键词【Peakfit】
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为了方便各位更快的找到自己所需要的科研软件,因此我做了一个往期软件目录,点击蓝色字体即可链接对应文章!
名称 | 主要功能 |
---|---|
HighScore3.0.5+ | XRD数据分析工具 |
Thermo Avantage | XPS数据分析工具 |
MDI Jade 6.5 | XRD数据分析 |
LabSpec | 拉曼光谱分析 |
MestReNova 14 | 核磁共振NMR数据处理 |
Image J | 科研图像处理工具 |
CasaXPS | XPS数据分析 |
RasMol 2.7.5.2 | 观察生物分子微观立体结构 |
Nano Measurer 1.2.5 | 纳米颗粒粒度分析软件 |
Diamond | 原子水平晶体结构可视化 |
Endnote | 文献管理软件 |
Origin | 数据分析工具 |
3Dsmax | 三维建模和渲染软件 |
DigitalMicrograph3.5 | 电镜图像分析软件 |
CrystalMaker | 晶体分子结构图绘制软件 |
目录
软件下载
软件介绍
安装教程
使用教程
软件下载
[软件名称]:Peakfit
[界面语言]:中文
[安装环境]:Win11/Win10/Win8/Win7
[系统位数]:32位&64位
[软件类型]:非线性拟合软件
[下载链接]:
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软件介绍
Peakfit,是一款功能强大的数据峰值拟合软件,用于进行峰值分析。用户只需将统计数据导入软件,即可自动拟合出各项数据的峰值,还能输入特定参数约束,以模拟特定情境下的峰值数据。该软件支持精准的检测、分离和量化隐藏功能,能够直接导入AIA、ASCII、函数、Excel等多种数据类型。软件体积小巧,只要是文本格式的数据都可以使用,适用于核磁、红外、XPS和拉曼等数据。
安装教程
注意事项
①解压安装包和软件安装时,关闭杀毒软件,否则安装文件容易被误删除;
②安装软件时,要右击压缩包,把压缩包解压出来,不要直接双击压缩包;
③安装包及软件安装路径,最好是英文或数字,如有中文路径,容易报错;
1. 下载安装压缩包,解压后选择安装文件,双击安装。如图所示。
2. 点击“Next”,继续安装。
3. 点击“yes”,继续安装。
4. 姓名和公司随便填,然后点击继续。
5. 选择安装位置后点击“Next”,继续安装。
6. 这个界面下直接点击下一步就可以了。
7.点击“finish”,完成安装。
8.自动跳转到注册界面,点击“update”,进行注册。
9.打开安装包中的“keygen.exe”文件,product选项选择“Peakfit v4.12”,然后点击generate,将License key中的数字复制到注册窗口中。最后点“update”完成注册。
10. 打开软件,点击“help”菜单,选择about peakfit。可以看到我们的软件版本为个人注册版,可以使用了。
使用教程
1、软件基本操作
PeakFit 软件基本操作界面如图2.1。 图1.1 PeakFit 软件基本操作界面
菜单栏基本操作及对应工具栏图标为:
File -- 包括文件导入、剪贴板导入
、文件保存
、关闭等操作,Ctrl+I 可快速导入文件;
Edit -- 对导入数据进行编辑操作(快捷键Ctrl+E);
Data -- 对导入数据进行各种处理操作,包括将测量信号与标准信号进行比对、XY 坐标转换
、谱峰面积标准化、异常点过滤
等;
Prepare -- 对谱峰进行拟合前操作,如选取待拟合数据范围(快捷键Ctrl+V)、平滑
、傅里叶转换
、去基线
等;
AutoFit -- 对谱峰进行拟合,常用的拟合操作有:残差最小化拟合(快捷键Ctrl+R)、二次导数极小值拟合
(快捷键Ctrl+S)和去卷积拟合
(快捷键Ctrl+D),也可根据用户自定义公式进行拟合
(快捷键Ctrl+U);
Help – 软件使用帮助。
2、 数据处理过程(拉曼光谱为例)
2.1 数据导入:通过File—Import、或点击按钮导入数据,支持ASCII(如.txt、.prn、.dat)、Excel、SigmaPlot、SPSS 等格式文件(此处以软件自带的Sample.xls 文件为例)。
图2.1 导入数据
如果文件中包含多列数据,依次选择两列作为X 轴和Y 轴。
图2.2 选择X 轴和Y 轴
确定文件名称和X 轴Y 轴标题。
图2.3 确定文件名称和X 轴Y 轴标题
图2.4 数据导入完成
如果导入的数据只有两列,软件会自动跳过图2.2 步骤;如果数据点较多(如100 ~ 4000cm-1),软件会提示是否减少数据点数量,通常选“否”:
图2.5 软件提示数据点过多,是否减少
2.2 选择待拟合数据范围:通过Prepare—Section、或点击进入以下界面。
图2.6 选择待拟合数据点
可以通过输入Xi和Xf值,并点击“Apply New”按钮来选择数据。也可以使用鼠标操作,具体方法如下:按住左键,将鼠标向右拖动以选择要去除的数据点,向左拖动以选择要拟合的数据点。操作完成后,上图会显示待拟合的谱峰,而下图会显示完整数据,未被选择的数据点将变成灰色。
图2.7 选择待拟合数据点
数据选择范围不仅要涵盖整个谱峰,还需包括谱峰两侧的基线数据。如果存在异常数据点,可以通过单击它们来排除,未选中的数据点将显示为灰色。完成数据选择后,点击“OK”返回,此时界面中只会显示待拟合的谱峰。
图2.8 数据选择完成
2.3 拟合前操作:对谱峰进行面积标准化、平滑、去基线等操作。
2.3.1 面积标准化(可选操作):面积标准化(可选操作):可以通过Data菜单下的“Area Normalize”选项来实现。此操作会将谱峰的积分面积调整为1。如果在进行“2.2 选择待拟合数据范围”之前执行该操作,则会将所有谱峰的积分面积之和调整为1。该步骤有助于对强度差异显著的数据进行标准化,以确保最终图形的一致性。
注:如果需要用到谱峰强度信息,则不能对数据进行面积标准化;如果用到的是谱峰强度比,则可在“2.2 选择待拟合数据范围”操作之前进行面积标准化。
图2.9 面积标准化
选择左侧的OK 按钮确定或者Undo 按钮撤销标准化操作。
2.3.2 去基线(可选操作):通过单击按钮进入去基线操作界面。
图2.10 去基线
可以通过左侧的算法选项来更改基线拟合方式:
Initial, Final Lin—通过首尾两个数据点进行线性拟合。
Progressive Lin—选择首尾一段范围内的数据点进行线性拟合,适用于基线清晰的情况。
2nd DerivZero—通过不同的方程(如线性、多项式、对数等)对基线进行拟合。
在此选用Progressive Lin方法。
可通过单击查看基线方程,确定之后单击
将基线从原始数据中去掉。去基线操作可单独进行,也可在谱峰拟合过程中同步进行。
2.3.3 平滑(可选操作):平滑操作主要针对峰宽较大、高频噪音明显的谱峰,如H2O 的对称伸缩振动峰。通过Prepare—Smoth、或单击按钮进入以下界面:
图2.11 谱峰平滑
平滑操作可通过不同算法完成,不同算法对谱峰平滑结果也不尽相同,可自行尝试。通过单击按钮进行自动平滑,完成之后单击OK 确定。
注:平滑操作不当会改变峰强和半高宽,不建议对峰宽较窄的峰进行平滑操作。
2.4 谱峰拟合
2.4.1 寻峰
通过AutoFit—AutoFit Peaks I Residuals 或单击、AutoFit Peaks II Second Derivative 单击
、AutoFit Peaks III Deconvolution 单击
进行谱峰拟合操作,此处以AutoFit Peaks I Residuals
为例。
图2.12 谱峰拟合操作界面
在左侧的Baseline选项中,由于之前已进行去基线操作,此处选择“No Baseline”。如果之前未进行去基线操作,可以选择不同的方程进行基线拟合。
在左侧的Smoothing选项中,同样由于已进行平滑操作,此处选择“None”。
在左侧的Peak Types选项中,选择用于拟合的方程。PeakFit自带78个分布方程,可针对绝大部分光谱和色谱数据进行拟合。第一个选框内选择“All Peak Fns”以调出所有分布方程,第二个选框内选择“Pearson IV”方程。
注:不同分布方程适用于拟合不同形态的谱峰。一般来说,非晶体和H_2O拉曼峰适合GaussAmp/Area方程,对称的晶体拉曼峰适合Gauss + Lor Amp/Area或Voigt Amp/Area方程,不对称的晶体拉曼峰适合Pearson IV方程,外源荧光或单色光谱峰适合Beta Amp/Area方程。
在左侧的AutoScan选项中,选择寻峰操作。Amp%确定寻峰的临界强度,即只有高于该强度的数据才被识别为信号,低于该强度的数据则被识别为噪音。如果软件识别出过多不必要的峰,可以通过增大Amp%的值来减少多余的弱峰。Vary Width和Vary Shape主要用于多峰拟合中,允许不同峰有不同的峰宽和形态。Add Residuals和Allow Negative对拟合结果影响不大。
注:某些情况下,软件自动寻峰的结果可能与实际情况有较大差异,此时可以通过手动操作进行修正。具体操作为:左键单击空白处可手动增加一个峰,左键单击峰顶可屏蔽该峰,左键双击峰顶可移除该峰,右键单击峰顶可调出更多操作选项(如更改拟合方程、更改拟合参数、锁定参数等)。
图2.13 拉曼峰编辑
2.4.2 拟合
重复点击左下角按钮进行数据拟合的迭代运算,单击小窗口中的Addl Adjust 按钮确认本次运算结果,直到结果不再改变。
图2.14 多次迭代进行数据拟合
迭代运算也可通过单击按钮进入以下界面后点击Addl Adjust 进行(同样需要重复进行直至结果不再改变)。
图2.15 多次迭代进行数据拟合
2.4.3 结果确认和导出
通过单击图2.14 小窗口或2.15 左侧的Review Fit 按钮查看谱峰拟合结果,也可通过单击图2.12 左下方
按钮查看拟合结果。
图2.16 查看拟合结果
Export:将拟合结果导出到文件中,可选ACSII、Excel 等数据格式。
图2.17 将拟合结果导出到文件中
Numeric:查看拟合得到的谱峰数据,包括拟合参数、谱峰位置、强度、面积、半高宽、对称性等参数以及各参数的标准差等。如果只需要查看最简单的谱峰信息,可通过单击图2.12 左侧按钮获得。可通过File—SaveAs 将结果导出到文件中
图2.18 查看谱峰拟合结果
图2.19 将谱峰拟合结果导出到文件中
Data:查看详细拟合数据(类似于Export 导出的数据),同样可以通过File—SaveAs 将数据导出到文件中。
Evaluation:对拟合结果进行评估(很少用)。
Residuals:查看拟合结果残差。
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—The end—
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