非因解读 | 单细胞空间蛋白质组学分析揭示临床显著性前列腺癌多参数相关MRI检查的异质性

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本研究通过单细胞空间蛋白分析技术，对比了mpMRI可见与不可见前列腺癌的肿瘤结构差异。结果显示，mpMRI可见的前列腺癌肿瘤具有更复杂的结构和较高的恶性细胞密度，这可能与较差的临床结果相关。mpMRI不可见的前列腺癌在分子和细胞水平上更接近正常组织。研究还发现，基质相关基因表达在mpMRI不可见的肿瘤中更高，可能影响mpMRI的检测能力。

摘要由CSDN通过智能技术生成

单细胞空间蛋白组分析是一项基于荧光标记抗体染色的超多标组织成像技术，该技术将多重蛋白表达谱的定性、定量信息与单细胞组织原位信息进行整合，可在一张病理切片上基于组织及细胞原位对多达60 种蛋白进行多种分析。

非因生物建立的单细胞空间蛋白组分析平台为临床病理组织的空间细胞生物学和蛋白功能深度分析提供了全新的分析手段，平台拥有350+ 经严格验证的抗体资源库，支持结合研究方向和研究热点设计灵活的整体实验方案，是肿瘤微环境、免疫学肿瘤生物学、神经生物学、病理标志物诊断的全新研究利器。

下面，我们通过一篇分析研究案例，来展示单细胞空间蛋白组学分析的应用场景和应用价值，以及结合其他组学技术进行肿瘤微环境研究和新型诊疗标志物发现的研究模式。

研究背景

由于前列腺癌筛查诊断准确性差而受到相当大的争议（1），前列腺多参数MRI（mpMRI）的使用迅速增加。由于技术的改进，可以使用mpMRI透视离散的前列腺内病变（2-5）。这些前列腺医学磁共振成像图像的解释和对前列腺癌的怀疑程度已随着前列腺成像报告和数据系统的发展而变得标准化（PI-RADS;参考文献6）。然而，mpMRI检查的假阳性（例如，PI-RADS分类4-5伴良性活检）和假阴性[例如，PI-RADS分类1-2伴有临床意义的前列腺癌（csPCa）]前列腺案例并不少见（7，8）。尽管存在许多准确的前列腺mpMRI解释的混杂因素（9），并且一些假阳性和假阴性的mpMRI结果可能归因于放射科医生解释的变异性（10，11），但一些前列腺癌肿瘤被认为是在mpMRI上固有的检测不到的（例如，“mpMRI不可见”）。mpMRI可见性与肿瘤学结果之间的潜在联系最近才被探索（12-15），并且由于mpMRI的相对现代使用，中长期肿瘤学结果非常有限。尽管之前已经报道了mpMRI可见性的分子特征（12，16，17），但将mpMRI可见性与临床结果联系起来的潜在分子和细胞机制尚未确定。

研究目的

为了更好地表征前列腺癌的mpMRI可见性，本研究使用单细胞空间蛋白分析（超多标多重免疫荧光，MxIF）和基因表达谱分析对接受根治性前列腺切除术的mpMRI可见和mpMRI不可见前列腺癌的临床匹配患者的组织进行分子和微量检查，以寻找mpMRI不可见的前列腺癌与mpMRI可见肿瘤以及正常的前列腺组织之间的肿瘤结构差异。

实验设计

研究者利用接受根治性前列腺切除术的临床匹配的mpMRI不可见和mpMRI可见csPCa患者的肿瘤组织，进行多重免疫荧光单细胞空间成像和基因表达谱分析，并专门开发了基于人工智能的分析算法来分析和表征肿瘤生态系统，并与相应的转录组学数据进行集成分析。