GenesClouds-CSDN博客

原创当拿到金葡菌的全基因组测序数据后该怎样进行分析呢

很多做科研实验/做课题报告的科研老师们在拿到全基因组测序数据之后要进行一系列的分析，但同时也担心数据庞大分析缓慢导致进度，也有因为不会编程不知道该如何进行拼接分析的...其实需要质控拼接、MLST分析及菌种鉴定等完全可以自己在平台上进行分析，下面以金葡菌为例进行了质控拼接及菌种鉴定等分析。网络图片（侵删）金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus，S. aureus)也称“金葡菌”，隶属于葡萄球菌属，是革兰氏阳性菌的代表，为一种常见的食源性致病微生物。那么在取得了金葡菌全基

2021-08-11 17:41:23 1340

原创一键搞定Krona图

尤其是现在这个季节，饮水量就会偏大，每个人的体质不同情况不同水中毒又叫高容量性低钠血症。我们的肾脏每小时只能过滤处理800-1000毫升的水，超过肾脏负荷的部分最终会进入细胞内，这会导致细胞内水肿。到了现在这个季节，饮水量就会偏大，更是有很多小伙伴更是抱着桶喝水，其实每个人的体质不同情况不同，也不是每个人每天喝水的量都是一样的。喝水也要讲究时间哦~给大家整理了一份超实用全面的时间表，正确的时间做正确的事情才能事半功倍你可能听说过喝水过量会导致水中毒，但你真的知道水中毒是什么吗？...

2021-08-02 17:53:26 1366

原创关于特征基因分析(Virulence/Resistance/Serotype)

中科助腾GenesClouds微生物数据分析平台支持食源性致病菌的血清型鉴定、耐药和毒力基因、菌种鉴定、cgMLST、wgSNP等功能，通过基于特征值的快速比对，可实现近缘食源性致病菌的快速识别与筛选，为基于基因组学的多领域、跨时空的微生物精准溯源及耐药性、致病性、毒性等识别和预测分析提供科学数据支持。当病原微生物引起传染病疫情时，预防医学工作者会面临以下问题：病源从哪里来？可能的传播途径是什么？病源有哪些生存能力，毒力和耐药特性如何？本图片来源于网络，侵删看完这篇文章相关的从业人员.

2021-07-16 21:53:02 1012

原创有关微生物全基因组测序数据分析，请看这篇文章

在当今社会微生物领域的关注度越来越高，当病原微生物引起传染病疫情时，预防医学工作者会面临以下问题：病源从哪里来？可能的传播途径是什么？病源有哪些生存能力，毒力和耐药特性如何？【图片来源于网络，侵删】基于全基因组测序的分型技术不仅可以快速检测病原菌，而且具有较高的准确度和分辨率。GenesClouds微生物数据分析平台整合基因组生物信息学分析功能，进行基因组数据的质控、拼接、wgMLST、wgSNP、基因组功能注释、耐药基因、毒力基因鉴定识别、血清型分析等，为基于基因组学的多领域、跨时空的.

2021-07-15 17:50:10 1363

原创介绍两款简单实用的微生物数据分析平台

在当今社会微生物领域的关注度越来越高，伴随着新一代基因组测序技术的发展，基于全基因组测序(WGS)的分子分型技术得到很好的应用，而用于微生物组数据分析的平台也越来越多。今天就来分享两款操作简单、功能齐全的微生物数据分析平台。一、BioNumericsBioNumerics软件一款多种生物信息数据格式存储和处理分析的软件平台。是全球唯一集电泳数据、色谱数据、光谱数据、表型特征数据、基因芯片、基因组序列、氨基酸序列等多种生物信息数据格式存储和处理分析的软件平台，包括数据存储、数据..

2021-07-08 17:51:50 1763

原创简单说说关于沙门氏菌的耐药分析

在微生物中沙门氏菌是一种常见的食源性致病菌。其鉴定的传统方法主要是根据形态学特征、培养特征、生理生化特征、抗原特征、噬菌体特征等。感染沙门氏菌的人或带菌者的粪便污染食品，可使人发生食物中毒。据统计在世界各国的种类细菌性食物中毒中，沙门氏菌引起的食物中毒常列榜首。【图片来源网络，侵删】沙门氏菌在水中不易繁殖，但可生存2-3周，冰箱中可生存3-4个月，在自然环境的粪便中可存活1-2个月。沙门氏菌最适繁殖温度为37℃，在20℃以上即能大量繁殖，因此低温储存食品是一项重要预防措施。【部分资料来源于网络】

2021-07-07 16:39:05 745

原创微生物全基因组测序分子分型技术在食源性疾病中的应用

随着新一代基因组测序技术的发展，基于全基因组测序（WGS）的分子分型技术在食源性疾病聚集性病例识别和爆发溯源调查中显示出极大的应用价值和发展潜力，而WGS技术的推广和使用需要解决庞大基因组数据的传输、储存、快速计算和精准比对，需要成熟易用的生物信息学分析流程和标准化解释系统。如何使用微生物信息分析工具将这些大量的基因组碎片整合以及将大量来源不同的基因组数据进行有效比对呢？中科助腾研究团队搭建了我国首个全基因组数据计算云引擎，将标准化的WGS数据分析流程转移到云端，大大降低了WGS数据分析、运算及使用

2021-06-29 14:43:27 395

原创基于全基因组测序(WGS)的分子分型技术在食源性疾病上的应用

食源性疾病是全球范围内重要的食品安全问题，早期发现和查明病因是防控食源性疾病的重要保证。随着新一代基因组测序技术的发展，基于全基因组测序（WGS）的分子分型技术在食源性疾病聚集性病例识别和爆发溯源调查中显示出极大的应用价值和发展潜力。在食品安全领域，越来越多的研究机构和监管部门将全基因组测序技术应用于食源性疾病疫情爆发的识别和监测, 并基于此技术进行疾病溯源追踪和污染调查等。本图片来源于网络，侵删基于全基因组测序的分型技术不仅可以快速检测病原菌, 而且具有较高的准确度和分辨率。而WGS技...

2021-06-25 17:25:03 630

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