本文介绍了如何分析金黄色葡萄球菌（金葡菌）的全基因组测序数据，包括质控、拼接、MLST分析、菌种鉴定等关键步骤。通过上传.fq文件进行质控检查，接着进行拼接分析，大约20-30分钟后可获取结果，并进行毒力、耐药性分析。此外，还涉及了MLST和cgMLST分析，以及菌种鉴定报告和Krona图展示。
很多做科研实验/做课题报告的科研老师们在拿到全基因组测序数据之后要进行一系列的分析，但同时也担心数据庞大分析缓慢导致进度，也有因为不会编程不知道该如何进行拼接分析的...其实需要质控拼接、MLST分析及菌种鉴定等完全可以自己在平台上进行分析，下面以金葡菌为例进行了质控拼接及菌种鉴定等分析。
网络图片（侵删）
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus，S. aureus)也称“金葡菌”，隶属于葡萄球菌 属，是革兰氏阳性菌的代表，为一种常见的食源性致病微生物。
那么在取得了金葡菌全基因组测序数据后要怎样分析呢？
首先查看了该测序数据的质控报告：
在上传了测序数据原始文件（以.fq为结尾的测序数据文件）后，可以看到有“质控”的标志
点“质控”之后可以看到报告结果
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