科研绘图系列:TreeAndLeaf二分类树构建

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介绍

树形图显示了二叉树,重点是表示树元素之间的层次关系。树状图包含节点、分支(边)、根和叶。根是分支和节点的来源,指示到叶的方向,即终端节点。

树形图布局的大部分空间用于排列分支和内部节点,留给叶子的空间有限。对于大的树形图,叶片标签通常被压缩到小的凹槽中。因此,当要显示的信息应该突出显示叶子时,树形图可能无法提供最佳布局。

TreeAndLeaf包旨在通过结合树形和力定向布局算法,将分析的重点转移到叶子上,从而提高树形图叶子的可视化效果。包的工作流程如图所示。

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加载R包

library("TreeAndLeaf")
library("RedeR")
library("igraph")
library("RColorBrewer")

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