Runtime Error VS Accepted （大整数排序 ）

读入字符串的两种不同方式导致两个截然不同的提交结果。。

http://ac.jobdu.com/problem.php?pid=1190

下面这个代码提交结果是是Accepted

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<algorithm> 
using namespace std;

struct BigNum
{
	int len;
	char str[1010];
}bigNum[110];

int cmp(const BigNum& a,const BigNum& b)
{
	if(a.len!=b.len)
		return a.len<b.len;
	else
		return strcmp(a.str,b.str)<0;
}

int main(void)
{
	int i,n;

	while(scanf("%d",&n)!=EOF)
	{
		//getchar();
		for(i=0;i<n;i++)
		{
			//gets(bigNum[i].str);
			scanf("%s",bigNum[i].str);
			bigNum[i].len=strlen(bigNum[i].str);
		}
		sort(bigNum,bigNum+n,cmp);
		for(i=0;i<n;i++)
			puts(bigNum[i].str);
	}
	return 0;
}

下面这个代码提交结果是是Runtime Error

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<algorithm> 
using namespace std;

struct BigNum
{
	int len;
	char str[1010];
}bigNum[110];

int cmp(const BigNum& a,const BigNum& b)
{
	if(a.len!=b.len)
		return a.len<b.len;
	else
		return strcmp(a.str,b.str)<0;
}

int main(void)
{
	int i,n;

	while(scanf("%d",&n)!=EOF)
	{
		getchar();
		for(i=0;i<n;i++)
		{
			gets(bigNum[i].str);
			//scanf("%s",bigNum[i].str);
			bigNum[i].len=strlen(bigNum[i].str);
		}
		sort(bigNum,bigNum+n,cmp);
		for(i=0;i<n;i++)
			puts(bigNum[i].str);
	}
	return 0;
}

至今还是不明白这是为什么，哎。。。