Matlab读取存储多维Tiff图像(hyperstacks)

本文介绍了如何使用Matlab-Image插件读取和存储多维Tiff图像(hyperstacks)。首先,在Fiji上安装ImageJ-Matlab插件,然后将脚本添加到Matlab路径。接着,通过调用ImageJ,可以方便地在Matlab中处理多维图像,并将其转换为数组。最后,提供了将Matlab数组保存为图像的示例。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Matlab读取存储多维Tiff图像(hyperstacks)

Matlab-Image 插件使用

介绍

科研中经常要使用Matlab处理显微镜图像。这些图像多为多维(XYCZT),读取与写入多为不便。经查阅后发现此问题已有解决方案,特分享如下。

在Fiji上安装ImageJ-Matlab插件

在这里插入图片描述

将脚本添加至路径

下载copytoImagePlus.mijmshow.m文件(NAS中share文件夹下)至你的fiji安装路径\fiji.app\scripts

在matlab中添加路径你的fiji安装路径\fiji.app\scripts

在这里插入图片描述

使用

进行操作前先输入ImageJ,会自动打开ImageJ软件

IJM.getDatasetAs('I');读取ImageJ打开的图像为变量名为‘I’的matlab数组

imp = copyto

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