新版CaImAn自动安装脚本 解决conda solving environment卡死

新版CaImAn自动安装脚本

新版CaIman发布，实验室师兄师姐都说安不上，不想一个个帮忙安装，于是写了脚本，特此分享。
具体思路是用新建虚拟环境安装mamba，再用mamba创建caiman虚拟环境。也可直接参考代码自行安装。

前置要求

安装anaconda，并将conda加入环境变量，具体参考：
Windows：
Anaconda从下载到环境变量配置(windows)
win10+python3下Anaconda的安装及环境变量配置
Linux：
Linux设置anaconda的环境变量

Windows系统需安装支持bash软件：
git bash
WSL

脚本

#!/bin/bash
echo -n "Enter your Anaconda path(Example: “D:/Program Files (x86)/Anaconda/”):"
read condapath
oldplace=envs/test/envs/caiman
newplace=envs/caiman
echo $condapath$oldplace
activateplace=bin/activate
conda create -yn test
conda env list
conda install -n test -yc conda-forge mamba
source activate test
conda env list
mamba create -yn caiman -c conda-forge caiman
conda env list
cp -r "$condapath$oldplace" "$condapath$newplace"
conda env list
source activate "$condapath$newplace"
conda env list
conda remove -yn test --all
conda env list
caimanmanager.py install

Windows系统新建.txt文档，将以上代码粘贴进去，并更改拓展名为.sh，选择使用刚刚下载的git bash文件打开。

输入安装的Anaconda目录，使用右斜杠 / ，结尾处也需要 / ，安装目录前后需要加英文双引号 " " 。

Linux系统将同样创建.sh文件，右击在当前目录打开命令行

sh ./你的文件名.sh

同样输入anaconda目录，以 / 结尾。

可能问题及解决

下载时卡住

请参考更换conda源
conda换源
conda更换国内源

CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED

出现该问题是因为验证出现问题，可通过修改conda配置文件解决
具体可参考：
『技术随手学』解决CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION 问题

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