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RSS订阅原创 Gene Ontology 的GO注释的可视化
Gene Ontology 的GO注释的可视化@TOC利用goatools和PyGraphviz可视化最近因为项目的原因，需要对GO terms的注释进行可视化，在此之前已经使用visio自己画了可视化的图(天啊，工作量真的好大，画起来太麻烦啦！)。偶然间发现了一个goatools这个可视化的工具，发现自己之前写太多代码了，明明可以直接掉包的==!。可视化的时候，必须要安装PyGraphvi...
2019-11-02 09:03:35
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原创 决策树与随机森林
一、决策树决策树包括3个步骤：特征选择 决策树的生成（决策树局部最优） 决策树的剪枝（决策树全局最优）1.特征选择 特征选择的准则是信息增益或者信息增益比、Gini指数。选取具有分类能力的特征可以提高学习效率。决策树中的信息增益等价于训练数据集中类与特征的互信息。2.生成（步骤和公式的话，《统计学习方法》讲的很清楚） 决策树学习采用自顶向下的递...
2019-04-24 11:25:23
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原创 LeetCode 最长有效括号-Python
给定一个只包含'('和')'的字符串，找出最长的包含有效括号的子串的长度。示例1:输入: "(()"输出: 2解释: 最长有效括号子串为 "()"示例 2:输入: ")()())"输出: 4解释: 最长有效括号子串为 "()()"思路：动态规划的思想，dp[i]为以s[i]为结尾的最长字符串的大小1.当s[i]='('时，dp[i]=02.当s[i]...
2019-04-19 17:21:59
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原创 LeetCode 73. 矩阵置零 python
给定一个m×n的矩阵，如果一个元素为0，则将其所在行和列的所有的元素都设为0，请使用原地算法。示例1:输入: [ [1,1,1], [1,0,1], [1,1,1]]输出: [ [1,0,1], [0,0,0], [1,0,1]]示例2:输入: [ [0,1,2,0], [3,4,5,2], [1,3,1,5]]输出:...
2019-03-20 08:51:13
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原创 keras踩坑（hyperas+多GPU）
Keras踩坑：1.设置earlystoppingfilepath = model_snapshot_directory + '/' + 'lstm_model-ep{epoch:03d}-loss{loss:.3f}-val_loss{val_loss:.3f}.h5'checkpoint = ModelCheckpoint(filepath, monitor='val_loss',...
2018-11-28 21:09:50
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原创 VMware Workstation pro14安装Ubuntu18出现的问题解决办法
安装了一个多小时的Ubuntu，每次都会卡在语言界面或者Ubuntu更新界面。经过多次关闭客户机和重启，之前根据百度的教程https://jingyan.baidu.com/article/ca00d56c2b5257e99febcf41.html 设置之后一直会卡死，经过修改：这里内存为1024发现远远不够，是最后系统安装卡死的主要原因，并且把存储为单个文件修改为最后一...
2018-11-08 11:13:40
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原创 《 LSTM: A Search Space Odyssey》IEEE-- 论文阅读
论文链接：LSTM：A Search Space Odyssey摘要：LSTM八中变体的三种应用：语音识别，手写字符识别，多风格音乐建模。每个应用中，分别用随机搜索（随机搜索用于在每个问题上寻找性能最好的超参数）优化超参数，并且使用fANOVA框架评估其重要性。经过多次试验证明，没有任何一个变体可以显著的改进标准的LSTM体系结构。介绍：LSTMs主要用于时间问题上，用于笔迹识别，语言建模...
2018-10-23 14:45:50
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原创 图像傅里叶变换
1. 图像的傅里叶变换傅里叶变换可以看成是时域和频域的转换。一维图像傅里叶变换公式（空间域->频域）：一维傅里叶变换逆变换公式（频域->空间域）：M×N图像的二维离散傅里叶变换：M×N图像的傅里叶变换：2. 时域和频域的转换我们已知，任意的周期函数都可以用sinx和cosx表示。数学上的傅里叶公式为首先理解欧拉公式（1） 复平面上的单位圆（用三角函数表示）如图所...
2018-04-27 16:14:26
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原创 opencv直方图匹配（规定化）
1.理解直方图匹配（规定化） 直方图规定化可以简要的理解为已有模板图像A，按照A图像的直方图对目标图像B的直方图修改，并应用到B图像上。如下图所示，表中第5行为A的直方图，第3行为B的直方图。计算直方图的规定化的步骤为：对图像A和B进行均衡化操作得到A、B的直方图，并分别计算累积直方图得到B到A的累计直方图的映射关系，即计算|V2-V1|的最小值，从第4、6行得到第7行的结果，因此映射关系如...
2018-04-26 15:33:53
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PHP+Python+JDK+Android+Apache+C++各种开发文档和手册
2017-12-21
空空如也
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